More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3069 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3069  adenylylsulfate kinase  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0903  adenylylsulfate kinase  98.54 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0866  adenylylsulfate kinase  96.59 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3723  adenylylsulfate kinase  92.68 
 
 
205 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0931  adenylylsulfate kinase  90.73 
 
 
205 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0957  adenylylsulfate kinase  90.73 
 
 
205 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3405  adenylylsulfate kinase  90.73 
 
 
205 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3040  adenylylsulfate kinase  92 
 
 
205 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0965  adenylylsulfate kinase  90.24 
 
 
205 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3184  adenylylsulfate kinase  82.93 
 
 
207 aa  361  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0962  adenylylsulfate kinase  82.93 
 
 
205 aa  360  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0666  adenylylsulfate kinase  81.09 
 
 
205 aa  350  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2888  adenylylsulfate kinase  71.88 
 
 
198 aa  293  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1500  adenylylsulfate kinase  62.5 
 
 
198 aa  256  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2622  adenylylsulfate kinase  62.24 
 
 
199 aa  254  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0591419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2135  adenylylsulfate kinase  59.39 
 
 
215 aa  250  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001704  adenylylsulfate kinase  62.37 
 
 
205 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00769  adenylylsulfate kinase  64.89 
 
 
205 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2100  adenylylsulfate kinase  61.03 
 
 
214 aa  247  8e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0423  adenylylsulfate kinase  66.67 
 
 
210 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  60 
 
 
214 aa  245  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0967  adenylylsulfate kinase  61.54 
 
 
213 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3434  adenylylsulfate kinase  61.54 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.658603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27091  adenylylsulfate kinase  58.46 
 
 
227 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3243  adenylylsulfate kinase  61.22 
 
 
201 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3058  adenylylsulfate kinase  61.22 
 
 
201 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4087  adenylylsulfate kinase  55.61 
 
 
212 aa  241  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3123  adenylylsulfate kinase  61.22 
 
 
201 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3084  adenylylsulfate kinase  61.22 
 
 
201 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3139  adenylylsulfate kinase  61.22 
 
 
201 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.476768  normal  0.15294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3302  adenylylsulfate kinase  61.03 
 
 
213 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02600  adenylylsulfate kinase  62.37 
 
 
201 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0938  Adenylyl-sulfate kinase  62.37 
 
 
201 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0833  adenylylsulfate kinase  61.03 
 
 
204 aa  239  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0864  adenylylsulfate kinase  65.71 
 
 
207 aa  240  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3051  adenylylsulfate kinase  62.37 
 
 
201 aa  240  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.256539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2888  adenylylsulfate kinase  62.37 
 
 
201 aa  240  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4002  adenylylsulfate kinase  62.37 
 
 
201 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02565  hypothetical protein  62.37 
 
 
201 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2876  adenylylsulfate kinase  62.37 
 
 
201 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.878793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3221  adenylylsulfate kinase  61.73 
 
 
201 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0939  adenylylsulfate kinase  57.36 
 
 
208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3359  adenylylsulfate kinase  66.28 
 
 
205 aa  238  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0820  adenylyl-sulfate kinase  60.41 
 
 
209 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01831  adenylylsulfate kinase  57.73 
 
 
217 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.573546  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  58.2 
 
 
638 aa  237  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3124  adenylylsulfate kinase  61.86 
 
 
201 aa  237  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0962  adenylylsulfate kinase  61.86 
 
 
201 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.510912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3516  adenylylsulfate kinase  66.08 
 
 
205 aa  236  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02401  adenylylsulfate kinase  55.9 
 
 
212 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1533  adenylylsulfate kinase  55.38 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1650  adenylylsulfate kinase  62.07 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  64.53 
 
 
604 aa  232  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  58.73 
 
 
203 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1862  adenylylsulfate kinase  56.61 
 
 
208 aa  232  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310492  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1068  sulfate adenylyltransferase, large subunit  56.06 
 
 
652 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  64.53 
 
 
614 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6392  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  58.08 
 
 
640 aa  231  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3831  adenylyl-sulfate kinase  58.51 
 
 
208 aa  231  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0800  adenylyl-sulfate kinase  55.9 
 
 
210 aa  230  9e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000729878 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01841  adenylylsulfate kinase  52.02 
 
 
207 aa  229  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2204  adenylylsulfate kinase  55.61 
 
 
203 aa  229  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  56.08 
 
 
201 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  63.01 
 
 
647 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  61.17 
 
 
639 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2957  adenylyl-sulfate kinase  55.67 
 
 
228 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1687  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  61.71 
 
 
638 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  56.38 
 
 
638 aa  228  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4225  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  62.57 
 
 
647 aa  227  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2985  adenylyl-sulfate kinase  55.78 
 
 
223 aa  227  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.879711  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0201  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  59.26 
 
 
644 aa  227  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02714  adenylylsulfate kinase  61.18 
 
 
198 aa  226  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  62.79 
 
 
640 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01861  adenylylsulfate kinase  53.44 
 
 
207 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2136  adenylylsulfate kinase  57.14 
 
 
199 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00619163  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  60.12 
 
 
633 aa  226  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  60.92 
 
 
644 aa  225  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16180  Adenylylsulfate kinase  64.57 
 
 
197 aa  225  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.732852  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0168  adenylylsulfate kinase  52.91 
 
 
211 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1689  adenylyl-sulfate kinase  54.08 
 
 
222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664653  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  59.57 
 
 
642 aa  224  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  62.43 
 
 
651 aa  224  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0194  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.9 
 
 
644 aa  223  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0986259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02135  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.85 
 
 
598 aa  223  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0186  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.9 
 
 
644 aa  223  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0471725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2185  adenylylsulfate kinase  53.85 
 
 
199 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  60.82 
 
 
640 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0754  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  57.14 
 
 
660 aa  222  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  58.2 
 
 
631 aa  221  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  58.2 
 
 
633 aa  221  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0212  adenylylsulfate kinase  61.99 
 
 
207 aa  221  6e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  59.54 
 
 
640 aa  221  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01951  adenylylsulfate kinase  52.66 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1425  adenylyl-sulfate kinase  55.56 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.403059  normal  0.0845056 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  57.14 
 
 
633 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0841  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  56.61 
 
 
660 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1305  adenylylsulfate kinase  53.97 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1145  adenylyl-sulfate kinase  53.97 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2145  adenylylsulfate kinase  53.19 
 
 
209 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0299  adenylylsulfate kinase  51.85 
 
 
225 aa  218  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>