176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2832 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  63.29 
 
 		 550 aa  732    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  63.29 
 
 		 550 aa  732    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  62.93 
 
 		 550 aa  728    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  63.29 
 
 		 550 aa  732    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  94.22 
 
 		 554 aa  1087    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  66.42 
 
 		 553 aa  784    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  69.69 
 
 		 557 aa  823    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  100 
 
 		 554 aa  1145    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  98.38 
 
 		 554 aa  1132    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  81.05 
 
 		 552 aa  948    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  63.29 
 
 		 550 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  98.56 
 
 		 554 aa  1133    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  61.78 
 
 		 550 aa  726    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  62.14 
 
 		 550 aa  727    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  81.77 
 
 		 554 aa  947    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  63.29 
 
 		 550 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  88.27 
 
 		 554 aa  1041    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  81.95 
 
 		 554 aa  967    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  61.84 
 
 		 550 aa  717    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  90.25 
 
 		 554 aa  1057    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  88.81 
 
 		 554 aa  1046    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  88.81 
 
 		 554 aa  1045    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  61.78 
 
 		 550 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  61.3 
 
 		 550 aa  716    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  63.29 
 
 		 550 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  63.11 
 
 		 550 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  63.29 
 
 		 550 aa  732    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  63.11 
 
 		 550 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  63.29 
 
 		 550 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  82.13 
 
 		 552 aa  959    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  62.5 
 
 		 565 aa  735    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  82.49 
 
 		 554 aa  952    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  62.39 
 
 		 550 aa  739    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  88.27 
 
 		 554 aa  1040    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  61.78 
 
 		 550 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  61.59 
 
 		 550 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  63.29 
 
 		 550 aa  732    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  63.11 
 
 		 550 aa  730    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  63.11 
 
 		 550 aa  732    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  83.03 
 
 		 552 aa  964    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02687  2-keto-3-deoxygluconate permease  64.38 
 
 		 499 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  51.72 
 
 		 557 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  51.72 
 
 		 556 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  52.01 
 
 		 557 aa  585  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  52.08 
 
 		 553 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  51.53 
 
 		 554 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 		 542 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  49.12 
 
 		 565 aa  552  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  49.36 
 
 		 542 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  50 
 
 		 539 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  51 
 
 		 555 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 		 547 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  51.86 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  50 
 
 		 553 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  51.86 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  48.37 
 
 		 542 aa  538  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  49.82 
 
 		 533 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  48.91 
 
 		 568 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  49.82 
 
 		 532 aa  533  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  48.28 
 
 		 537 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  48.47 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  48.74 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  49.37 
 
 		 533 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  48.64 
 
 		 568 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  49.01 
 
 		 544 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  47.45 
 
 		 553 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  47.85 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  48.31 
 
 		 550 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  48.83 
 
 		 533 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  48.83 
 
 		 533 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  48.02 
 
 		 531 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  48.5 
 
 		 566 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  48.11 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  49.64 
 
 		 559 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  48.65 
 
 		 531 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  47.45 
 
 		 549 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  44.68 
 
 		 545 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  47.12 
 
 		 537 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  44.68 
 
 		 545 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  47.02 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  45.52 
 
 		 549 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  45.96 
 
 		 546 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  46.88 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  44.6 
 
 		 555 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  45.94 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  46.42 
 
 		 525 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  45.28 
 
 		 552 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  44.82 
 
 		 551 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  46.08 
 
 		 543 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  46.79 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  44.52 
 
 		 547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  44.88 
 
 		 547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  45.92 
 
 		 542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  45.8 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  44.52 
 
 		 526 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  45.65 
 
 		 552 aa  455  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12416  predicted protein  43.39 
 
 		 551 aa  454  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>