More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2831 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 		 376 aa  785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  95.26 
 
 		 380 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  94.47 
 
 		 380 aa  748    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  78.44 
 
 		 371 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  84.88 
 
 		 325 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  72.75 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  72.55 
 
 		 406 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  71.99 
 
 		 387 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  68.72 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  58.93 
 
 		 374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  58.1 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  55.85 
 
 		 365 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  54.6 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  54.11 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  53.43 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.98 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  42.86 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  42.78 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.45 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  42.21 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.21 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.81 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.21 
 
 		 375 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.48 
 
 		 375 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  41.36 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.08 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  40.97 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  40.97 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.36 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  40.97 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  42 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.64 
 
 		 385 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.43 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.43 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  40.69 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  40.69 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  40.23 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  40.69 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  40.69 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.48 
 
 		 386 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.4 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.36 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.79 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.5 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  40.9 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  40.9 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  42.36 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.21 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.59 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  41.81 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  37.68 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  40.45 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  38.27 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  37.73 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.33 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.4 
 
 		 414 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  38.75 
 
 		 358 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  36.8 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  38.11 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  37.64 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  36.21 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  37.68 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.64 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.73 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.36 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  36.26 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  36.31 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  37.53 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  36.76 
 
 		 334 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.02 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  35.16 
 
 		 662 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  34.48 
 
 		 585 aa  199  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.62 
 
 		 585 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  34.34 
 
 		 606 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  34.34 
 
 		 606 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  33.53 
 
 		 605 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.33 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  32.66 
 
 		 605 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  37.27 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 		 625 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.4 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.4 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.4 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  35.4 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  35.4 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.4 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.4 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.4 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.62 
 
 		 669 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.4 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  31.53 
 
 		 597 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.64 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  30.89 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  32.37 
 
 		 670 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  32.3 
 
 		 627 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.47 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.47 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.5 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>