84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2786 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  70.59 
 
 
566 aa  804    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  94.52 
 
 
566 aa  1079    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  77.9 
 
 
566 aa  885    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1164    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  70.77 
 
 
566 aa  809    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  95.94 
 
 
566 aa  1092    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  68.63 
 
 
566 aa  786    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  78.9 
 
 
580 aa  901    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  70.41 
 
 
566 aa  811    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  29.5 
 
 
571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  26.68 
 
 
602 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  25.13 
 
 
580 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  25.37 
 
 
577 aa  171  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  25.91 
 
 
577 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  25.31 
 
 
576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  24.63 
 
 
577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  24.63 
 
 
577 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  24.21 
 
 
576 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  24.19 
 
 
576 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  23.83 
 
 
576 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  25.1 
 
 
769 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  25 
 
 
770 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  25.81 
 
 
770 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.3 
 
 
530 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  25.52 
 
 
770 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  24.9 
 
 
770 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  25.9 
 
 
772 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  24.95 
 
 
769 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  23.8 
 
 
770 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  22.67 
 
 
691 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.19 
 
 
769 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  24.65 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  23.42 
 
 
770 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  26.37 
 
 
768 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  26.36 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  28.7 
 
 
816 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  34.29 
 
 
181 aa  63.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  30 
 
 
238 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  28.7 
 
 
816 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  29.7 
 
 
300 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  28.7 
 
 
816 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  24.68 
 
 
534 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  33.96 
 
 
757 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4520  hypothetical protein  31.62 
 
 
149 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  28.24 
 
 
240 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  22.75 
 
 
519 aa  58.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  33.02 
 
 
755 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  23.9 
 
 
424 aa  57.4  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  33.02 
 
 
755 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  31.43 
 
 
838 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  25.12 
 
 
449 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  26.01 
 
 
818 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  22.73 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  27.93 
 
 
332 aa  55.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  22.49 
 
 
720 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  31.62 
 
 
838 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  31.43 
 
 
836 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  33.02 
 
 
759 aa  54.7  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  22.19 
 
 
720 aa  53.5  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  22.19 
 
 
720 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  28.76 
 
 
746 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  30.48 
 
 
838 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  32 
 
 
180 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
351 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  30.19 
 
 
440 aa  50.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  28.57 
 
 
621 aa  50.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  28.1 
 
 
828 aa  50.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  21.56 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  21.26 
 
 
722 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  22.41 
 
 
722 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  22.41 
 
 
722 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  26.11 
 
 
354 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  24.22 
 
 
203 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  23.84 
 
 
829 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  33.33 
 
 
829 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  21.26 
 
 
722 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2239  hypothetical protein  26.39 
 
 
154 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  24.79 
 
 
684 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  21 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  32 
 
 
829 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  38.55 
 
 
351 aa  43.5  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>