36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2702 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  98.88 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  97.77 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  92.74 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  92.74 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  92.18 
 
 		 179 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  92.18 
 
 		 179 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  91.06 
 
 		 179 aa  343  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  92.18 
 
 		 179 aa  342  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  58.24 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  59.12 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  48.6 
 
 		 179 aa  201  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  55.35 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  24.48 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  28.57 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  28.57 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  28.92 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  25.9 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2231  YfaZ family protein  27.23 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0687598  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0132  YfaZ  25.41 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00180457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  26.52 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  27.43 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  27.43 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  27.43 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  27.43 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  25.41 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  26.86 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  28.18 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  24.31 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2334  YfaZ family protein  22.22 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6281  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0581  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  29.73 
 
 		 181 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2545  outer membrane protein, YfaZ  26.14 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2404  outer membrane protein, YfaZ  26.14 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3391  YfaZ protein  26.14 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>