More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2576 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  85.34 
 
 		 232 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  79.31 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  79.31 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  79.31 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  78.88 
 
 		 233 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  78.54 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  77.14 
 
 		 106 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  37.96 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  39.41 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  33.82 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  39.71 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  45.76 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.16 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  29.24 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  25 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.9 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
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NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
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NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
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