298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2562 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  98.64 
 
 
295 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  97.97 
 
 
295 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  83.39 
 
 
295 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  83.73 
 
 
295 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  83.73 
 
 
295 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  71.78 
 
 
312 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  71.38 
 
 
298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  65.99 
 
 
299 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.47 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  50.88 
 
 
307 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  50.18 
 
 
307 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  46.76 
 
 
336 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  50.18 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  48.1 
 
 
323 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  46.15 
 
 
310 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  51.59 
 
 
309 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  51.59 
 
 
309 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  51.59 
 
 
307 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  48.14 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  49.47 
 
 
297 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.07 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  50.18 
 
 
307 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  45.23 
 
 
293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  49.82 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  49.82 
 
 
323 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  49.82 
 
 
306 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  49.82 
 
 
306 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  49.82 
 
 
306 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  49.82 
 
 
306 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  49.82 
 
 
306 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  49.82 
 
 
306 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.24 
 
 
291 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.91 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  36.46 
 
 
303 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  35.76 
 
 
303 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  38.14 
 
 
301 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  37.41 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  37.04 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  37.04 
 
 
303 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  37.04 
 
 
303 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  37.04 
 
 
303 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  37.04 
 
 
303 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  40.97 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.58 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  36.49 
 
 
303 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  36.7 
 
 
303 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.83 
 
 
296 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  35.81 
 
 
301 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.79 
 
 
287 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  35.81 
 
 
301 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  35.64 
 
 
300 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  38.36 
 
 
300 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  33.56 
 
 
322 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  39.57 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  35.84 
 
 
293 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  34.41 
 
 
319 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  34.15 
 
 
299 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  38.25 
 
 
296 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  28.23 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  33.78 
 
 
298 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  38.69 
 
 
296 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 
290 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.78 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 
283 aa  119  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  34.56 
 
 
288 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 
302 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  29.59 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.91 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  29.29 
 
 
296 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  31.39 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  31.31 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  32.78 
 
 
360 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.77 
 
 
289 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  31.03 
 
 
288 aa  106  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  34.72 
 
 
286 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
301 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  28.42 
 
 
298 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  29.93 
 
 
277 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.75 
 
 
252 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.8 
 
 
292 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  28.48 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  25.91 
 
 
290 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  29.82 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  28.83 
 
 
305 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  31.43 
 
 
317 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>