112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2508 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  100 
 
 
639 aa  1323  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  64.39 
 
 
639 aa  840  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  83.54 
 
 
639 aa  1136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  4.44921e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  97.18 
 
 
639 aa  1271  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  98.59 
 
 
639 aa  1309  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  84.33 
 
 
639 aa  1158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  60.67 
 
 
640 aa  784  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  84.01 
 
 
639 aa  1155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  87.93 
 
 
639 aa  1199  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  62.29 
 
 
646 aa  797  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  83.86 
 
 
639 aa  1151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.58979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  65.98 
 
 
639 aa  875  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  33.89 
 
 
650 aa  338  2e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  33.99 
 
 
650 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.35795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  33.78 
 
 
650 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  33.84 
 
 
650 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  7.31399e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  33.79 
 
 
650 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.05402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  33.63 
 
 
650 aa  330  5e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  32.49 
 
 
656 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  29.02 
 
 
663 aa  287  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  30.92 
 
 
655 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  32.52 
 
 
667 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.045e-05  hitchhiker  6.06277e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  31.22 
 
 
671 aa  260  5e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  30.21 
 
 
653 aa  255  2e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  31.42 
 
 
656 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.37992e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  26.58 
 
 
785 aa  228  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  29.54 
 
 
660 aa  216  1e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  30.09 
 
 
671 aa  214  5e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  27.48 
 
 
764 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  25.55 
 
 
714 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  4.68411e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  26.53 
 
 
727 aa  151  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.58 
 
 
731 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.84393e-06  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.83 
 
 
745 aa  149  1e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  27.38 
 
 
735 aa  149  1e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  26.48 
 
 
730 aa  147  8e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.52412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  26.75 
 
 
730 aa  147  8e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  26.07 
 
 
822 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  25.81 
 
 
731 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  26.34 
 
 
730 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.96014e-05  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  26.08 
 
 
729 aa  144  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.86 
 
 
782 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  25.93 
 
 
724 aa  137  7e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.33685e-05  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  25.67 
 
 
719 aa  136  1e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  25 
 
 
716 aa  135  2e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  24.23 
 
 
722 aa  135  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  28.55 
 
 
742 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  28.26 
 
 
742 aa  133  8e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  24.73 
 
 
720 aa  133  1e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  27.93 
 
 
742 aa  133  1e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  25.06 
 
 
833 aa  132  2e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.07 
 
 
895 aa  129  2e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.82 
 
 
826 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  24.38 
 
 
745 aa  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.2 
 
 
741 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  4.2193e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 
725 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 
764 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  22.91 
 
 
738 aa  120  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.43 
 
 
936 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 
755 aa  114  4e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.17 
 
 
820 aa  112  1e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  22.91 
 
 
893 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  27.68 
 
 
885 aa  111  4e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.5 
 
 
762 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.38 
 
 
762 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  7.40819e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 
764 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.8 
 
 
761 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.67 
 
 
761 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 
764 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  8.91097e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.98 
 
 
762 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  24.7 
 
 
724 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  24.07 
 
 
758 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 
766 aa  100  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  23.52 
 
 
754 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  23.19 
 
 
762 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  6.43351e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.33 
 
 
729 aa  97.8  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  2.80036e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.64 
 
 
765 aa  97.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  28.81 
 
 
843 aa  94.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  8.08171e-07 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.05 
 
 
731 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  26.12 
 
 
809 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  25.88 
 
 
898 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.16 
 
 
898 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  24.66 
 
 
788 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.16 
 
 
898 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.38 
 
 
788 aa  84.3  7e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  27.83 
 
 
741 aa  83.6  1e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.1 
 
 
778 aa  81.3  6e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  23.51 
 
 
677 aa  79.3  2e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.3 
 
 
945 aa  78.6  3e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  22.59 
 
 
757 aa  73.9  8e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.3 
 
 
770 aa  71.2  5e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  28.22 
 
 
612 aa  71.2  6e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.31 
 
 
816 aa  71.2  6e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  31.98 
 
 
789 aa  67.8  6e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  29.63 
 
 
789 aa  65.9  2e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  28.8 
 
 
655 aa  65.5  3e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  30.48 
 
 
642 aa  63.5  1e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  26.49 
 
 
657 aa  62.4  3e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  26.42 
 
 
701 aa  61.6  4e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  26.42 
 
 
701 aa  61.6  5e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  26.42 
 
 
701 aa  61.2  5e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>