28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2414 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  99.15 
 
 
234 aa  469  1e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  97.86 
 
 
234 aa  465  1e-130  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  93.59 
 
 
234 aa  453  1e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  88.03 
 
 
234 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  87.18 
 
 
246 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  87.18 
 
 
246 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  86.75 
 
 
246 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  86.75 
 
 
246 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1597  hypothetical protein  72.96 
 
 
233 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.321672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1601  hypothetical protein  71.49 
 
 
235 aa  355  2e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00766974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  72.53 
 
 
232 aa  350  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.81321e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1505  hypothetical protein  73.87 
 
 
234 aa  346  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1835  hypothetical protein  72.02 
 
 
246 aa  333  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2753  hypothetical protein  70.39 
 
 
234 aa  324  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15175  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0241  hypothetical protein  62.77 
 
 
241 aa  305  6e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3913  hypothetical protein  65.52 
 
 
234 aa  303  2e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.17623e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2105  hypothetical protein  64.38 
 
 
234 aa  302  4e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.796531 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0530  hypothetical protein  56.65 
 
 
234 aa  300  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1227  hypothetical protein  61.47 
 
 
234 aa  298  5e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.04269e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4969  hypothetical protein  62.84 
 
 
236 aa  298  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.349038  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001025  hypothetical protein  57.94 
 
 
235 aa  288  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07109  hypothetical protein  57.94 
 
 
235 aa  287  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1445  hypothetical protein  57.21 
 
 
240 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1017  hypothetical protein  49.36 
 
 
236 aa  214  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1501  hypothetical protein  48.65 
 
 
236 aa  188  5e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  23.44 
 
 
200 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  4.77853e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  22.82 
 
 
199 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.10329e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>