More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2374 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  99.31 
 
 		 290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  97.93 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  92.39 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  92.39 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  92.39 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  92.39 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  89.27 
 
 		 289 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  73.36 
 
 		 297 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 		 289 aa  461  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  72.32 
 
 		 289 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  76.45 
 
 		 289 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  74.19 
 
 		 286 aa  454  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  67.13 
 
 		 289 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  68.86 
 
 		 289 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  46.37 
 
 		 290 aa  295  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  46.15 
 
 		 287 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  46.15 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  99.18 
 
 		 122 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  42.96 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  44.36 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  40.55 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  41.7 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  31.99 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  29.76 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  28.35 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  27.51 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  27.93 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  27.34 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  27.31 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  25.86 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  26.3 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  26.09 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  27.76 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  27.6 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  26.43 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  26.67 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  24.91 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  37.23 
 
 		 641 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  48.68 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.34 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 459 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.34 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 679 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  38.53 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.82 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.35 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  34.91 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.82 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  39.8 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  46.05 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  34.71 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37 
 
 		 464 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  32.71 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  37.61 
 
 		 890 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  44.16 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  44.09 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  47.89 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.45 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.15 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  35.58 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  36.19 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.29 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  47.22 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.1 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 		 219 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  42.22 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 		 1264 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.45 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.33 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  38.95 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.21 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 543 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  32.82 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>