More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2368 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  79.64 
 
 		 441 aa  741    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  95.02 
 
 		 442 aa  868    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  82.13 
 
 		 441 aa  762    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  79.41 
 
 		 442 aa  745    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  91.86 
 
 		 442 aa  850    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  80.32 
 
 		 442 aa  757    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  91.86 
 
 		 442 aa  850    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  82.13 
 
 		 442 aa  764    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  80.32 
 
 		 440 aa  746    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  100 
 
 		 442 aa  906    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  100 
 
 		 442 aa  906    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  91.86 
 
 		 442 aa  848    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  79.86 
 
 		 442 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  92.08 
 
 		 442 aa  852    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  99.77 
 
 		 442 aa  905    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  93.21 
 
 		 442 aa  854    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  58.09 
 
 		 451 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  58.09 
 
 		 451 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  53.2 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  51.36 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  50.11 
 
 		 450 aa  468  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  50.34 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  50.34 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  49.54 
 
 		 450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  46.45 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  46.96 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  46.21 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  46.21 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  46.21 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  46.56 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  46.4 
 
 		 430 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  46.64 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  46.64 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  46.64 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  46.64 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  46.64 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  46.17 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  46.17 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  46.95 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  46.17 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  46.17 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  46.17 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  46.17 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  46.28 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  46.17 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  45.94 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  46.95 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  43.67 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  45.5 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  43.89 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  42.09 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  45.48 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  45.01 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  43.41 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  43.19 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  45.12 
 
 		 419 aa  358  7e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  45.12 
 
 		 419 aa  358  9e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  42.57 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  41.57 
 
 		 434 aa  355  6.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  42.34 
 
 		 433 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  43.56 
 
 		 439 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  43.33 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  43.59 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  41.76 
 
 		 428 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 445 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  43.6 
 
 		 432 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  41.16 
 
 		 433 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  43.13 
 
 		 432 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  41.65 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  42.99 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  41.42 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  41.19 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  41.71 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  40.89 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  40.9 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  41.07 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  40.31 
 
 		 474 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  39.33 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  41.13 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  42.45 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  42.89 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  40.23 
 
 		 443 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  41.87 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  39.63 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  41.13 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  38.62 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  43.06 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  41.13 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  40.89 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  39.06 
 
 		 408 aa  309  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  41.78 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  39.29 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  39.5 
 
 		 430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  39.86 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  40.42 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  40.14 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  40.32 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  38.6 
 
 		 430 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  38.6 
 
 		 430 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  39.64 
 
 		 431 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>