More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2347 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  78.88 
 
 
486 aa  788  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  91.41 
 
 
489 aa  919  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  91.41 
 
 
489 aa  919  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  96.73 
 
 
489 aa  972  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  73.42 
 
 
490 aa  725  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  91.41 
 
 
489 aa  919  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  78.67 
 
 
486 aa  758  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  77.1 
 
 
486 aa  748  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  91.41 
 
 
489 aa  919  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  98.98 
 
 
489 aa  994  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  91.53 
 
 
485 aa  915  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  77.32 
 
 
485 aa  768  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
489 aa  1000  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  1.08832e-09 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  80.16 
 
 
489 aa  790  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  99.39 
 
 
489 aa  996  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  79.14 
 
 
489 aa  780  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  47.59 
 
 
487 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  45.64 
 
 
484 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  47.71 
 
 
488 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  46.27 
 
 
481 aa  400  1e-110  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  43.42 
 
 
483 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  45.19 
 
 
483 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  45.49 
 
 
484 aa  392  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  44.7 
 
 
487 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  44.7 
 
 
487 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  44.49 
 
 
487 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  43.98 
 
 
484 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  44.49 
 
 
487 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  44.49 
 
 
487 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  43.58 
 
 
487 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  44.07 
 
 
487 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  44.07 
 
 
487 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  43.51 
 
 
487 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.25556e-05  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  44.07 
 
 
487 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  44.07 
 
 
487 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  44.07 
 
 
487 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  44.07 
 
 
487 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  44.07 
 
 
487 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  43.86 
 
 
487 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  43.86 
 
 
487 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  44.57 
 
 
524 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  43.84 
 
 
488 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  44.57 
 
 
494 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.73921e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  44.35 
 
 
494 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  43.04 
 
 
487 aa  356  4e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  43.1 
 
 
487 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  42.17 
 
 
487 aa  349  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  36.17 
 
 
484 aa  269  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
502 aa  256  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.69 
 
 
503 aa  246  7e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  33.84 
 
 
473 aa  245  1e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35.4 
 
 
479 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 
478 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 
478 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  33.26 
 
 
478 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  36.55 
 
 
500 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  33.26 
 
 
475 aa  223  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
478 aa  221  2e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 
605 aa  221  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 
483 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  34.11 
 
 
477 aa  215  1e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  33.7 
 
 
518 aa  214  2e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  37.94 
 
 
490 aa  213  6e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  32.98 
 
 
477 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.10651e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  33.56 
 
 
477 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  33.65 
 
 
478 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  33.65 
 
 
478 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
477 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.37 
 
 
561 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  32.17 
 
 
477 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.29 
 
 
569 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.29 
 
 
567 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  34.35 
 
 
477 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 
480 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  30.63 
 
 
565 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  30.67 
 
 
562 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.14 
 
 
573 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 
486 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  38.4 
 
 
494 aa  187  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  28.87 
 
 
474 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  35.18 
 
 
411 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  29.62 
 
 
562 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  30.98 
 
 
554 aa  175  2e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  28.08 
 
 
566 aa  173  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  31.23 
 
 
568 aa  173  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  29.96 
 
 
533 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  30.56 
 
 
533 aa  171  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  26.96 
 
 
553 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  26.93 
 
 
561 aa  159  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  33.12 
 
 
590 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 
569 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  34.87 
 
 
533 aa  153  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.22653e-06  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  32.69 
 
 
564 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  32.36 
 
 
564 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  35.27 
 
 
560 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
481 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  35.27 
 
 
572 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  32.69 
 
 
588 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  35.27 
 
 
572 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35.27 
 
 
572 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>