More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2182 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  97.46 
 
 
236 aa  469  1e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  97.03 
 
 
236 aa  464  1e-130  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  89.83 
 
 
236 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  85.04 
 
 
237 aa  404  1e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  84.62 
 
 
237 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  84.62 
 
 
237 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  84.62 
 
 
237 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  82.2 
 
 
236 aa  399  1e-110  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  74.36 
 
 
234 aa  356  2e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  70.48 
 
 
233 aa  329  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  66.81 
 
 
238 aa  315  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  62.34 
 
 
239 aa  311  5e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  62.34 
 
 
239 aa  297  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  63.18 
 
 
247 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  64.38 
 
 
236 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  51.72 
 
 
234 aa  224  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  50.86 
 
 
233 aa  215  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  50.43 
 
 
233 aa  214  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  50.43 
 
 
233 aa  212  4e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  49.14 
 
 
233 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  49.57 
 
 
233 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  50.66 
 
 
231 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  49.79 
 
 
233 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  50 
 
 
237 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  49.36 
 
 
231 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  49.36 
 
 
231 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  49.36 
 
 
231 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  48.94 
 
 
231 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  48.94 
 
 
231 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  48.07 
 
 
233 aa  201  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  50.21 
 
 
233 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  46.22 
 
 
239 aa  198  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  48.71 
 
 
232 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  48.71 
 
 
232 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  48.71 
 
 
232 aa  198  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  47.6 
 
 
231 aa  195  5e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  47.6 
 
 
231 aa  195  5e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  47.6 
 
 
231 aa  195  5e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  47.6 
 
 
231 aa  195  5e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  47.6 
 
 
231 aa  195  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.8735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  47.6 
 
 
231 aa  195  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  47.6 
 
 
231 aa  195  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  47.16 
 
 
231 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  47.86 
 
 
231 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  46.44 
 
 
238 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  46.64 
 
 
224 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  46.19 
 
 
224 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  46.38 
 
 
236 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  45.58 
 
 
227 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  46.19 
 
 
224 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  45.74 
 
 
224 aa  184  1e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  43.95 
 
 
224 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  45.26 
 
 
237 aa  178  6e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  43.24 
 
 
224 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  44.39 
 
 
224 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  45.37 
 
 
226 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  42.92 
 
 
233 aa  168  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  44.84 
 
 
225 aa  164  1e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  41.45 
 
 
237 aa  164  2e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  44.64 
 
 
228 aa  163  2e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  44.49 
 
 
226 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  41.15 
 
 
228 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  43.72 
 
 
232 aa  157  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  42.52 
 
 
266 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  41.36 
 
 
239 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  40.95 
 
 
233 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  41.36 
 
 
237 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  40.27 
 
 
220 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  37.56 
 
 
226 aa  147  1e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  37.56 
 
 
226 aa  147  2e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  41.38 
 
 
235 aa  146  2e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  39.73 
 
 
223 aa  141  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  41.36 
 
 
229 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  42.15 
 
 
229 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  40.45 
 
 
229 aa  136  3e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.81298e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  38.05 
 
 
223 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  37.61 
 
 
223 aa  134  1e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  42.27 
 
 
229 aa  134  1e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  36.24 
 
 
235 aa  127  1e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  2.68833e-06 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  35.17 
 
 
230 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  1.26844e-09 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  39.56 
 
 
231 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  34.25 
 
 
223 aa  117  1e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1984  peptidase M22, glycoprotease  35.93 
 
 
227 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2210  hypothetical protein  38.3 
 
 
188 aa  115  7e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
222 aa  115  8e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  115  8e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1706  metal (zinc) dependent glycoprotease  34.5 
 
 
227 aa  111  8e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0175811  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  35 
 
 
239 aa  110  2e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0370  peptidase M22 glycoprotease  44.3 
 
 
248 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47647e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  35.56 
 
 
246 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  37.44 
 
 
229 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  34.96 
 
 
267 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  43.45 
 
 
276 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  33.61 
 
 
279 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  36.22 
 
 
225 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  34.2 
 
 
246 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  30.94 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  33.62 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  33.77 
 
 
252 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>