187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2167 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  71.93 
 
 		 591 aa  912    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  92.77 
 
 		 592 aa  1160    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  70.46 
 
 		 609 aa  901    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1241    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  99.66 
 
 		 596 aa  1233    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  73.49 
 
 		 599 aa  932    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  85.83 
 
 		 590 aa  1080    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  98.49 
 
 		 596 aa  1224    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  72.39 
 
 		 595 aa  909    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  85.83 
 
 		 590 aa  1075    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  75.08 
 
 		 590 aa  937    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  74.62 
 
 		 592 aa  944    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  86.17 
 
 		 590 aa  1081    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  85.33 
 
 		 590 aa  1080    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  86.17 
 
 		 590 aa  1082    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  75.08 
 
 		 592 aa  939    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  34.8 
 
 		 602 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  33.27 
 
 		 582 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  30.02 
 
 		 635 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  30.7 
 
 		 578 aa  266  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  29.24 
 
 		 542 aa  263  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  28.16 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  28.42 
 
 		 542 aa  223  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  27.6 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  26.24 
 
 		 548 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  27.11 
 
 		 628 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  26.39 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  25.56 
 
 		 581 aa  137  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  23.55 
 
 		 615 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  23.42 
 
 		 614 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 540 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  22.87 
 
 		 615 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  22.6 
 
 		 615 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  23.73 
 
 		 613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  23.79 
 
 		 615 aa  117  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  24.84 
 
 		 605 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  24.75 
 
 		 543 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  22.59 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  24.03 
 
 		 502 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  23.95 
 
 		 583 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  22.26 
 
 		 616 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  22.6 
 
 		 616 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  22.45 
 
 		 616 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  22.6 
 
 		 616 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  21.06 
 
 		 617 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  28.12 
 
 		 506 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  21.88 
 
 		 613 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  22.46 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  24.25 
 
 		 603 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  24.29 
 
 		 603 aa  97.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  24.09 
 
 		 603 aa  97.4  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  24.64 
 
 		 594 aa  97.4  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  24.59 
 
 		 595 aa  97.1  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  25 
 
 		 624 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  24.25 
 
 		 603 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  25.34 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  23.94 
 
 		 603 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  23.31 
 
 		 589 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  23.14 
 
 		 619 aa  94  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  23 
 
 		 589 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  26.18 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  27.78 
 
 		 609 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  25.82 
 
 		 611 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  33.14 
 
 		 621 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  23.21 
 
 		 609 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  25.47 
 
 		 522 aa  92  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  28.68 
 
 		 605 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  27.06 
 
 		 592 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  24.4 
 
 		 607 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  24.4 
 
 		 607 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  24.4 
 
 		 607 aa  90.9  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  22.69 
 
 		 627 aa  90.9  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  23.69 
 
 		 616 aa  90.5  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  24.65 
 
 		 618 aa  90.5  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  31.67 
 
 		 610 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  24.52 
 
 		 614 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  25.42 
 
 		 609 aa  87.8  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  22.81 
 
 		 591 aa  87.8  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  23.08 
 
 		 602 aa  87  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  24.52 
 
 		 614 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  24.24 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  24.24 
 
 		 617 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  28.81 
 
 		 607 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  31.18 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  30.89 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  30.89 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  30.89 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  26.69 
 
 		 610 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  25.36 
 
 		 621 aa  84.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  25.81 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  21.92 
 
 		 601 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  22.76 
 
 		 617 aa  84  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  30.59 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  23.55 
 
 		 1283 aa  83.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  20.44 
 
 		 613 aa  83.2  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  22.67 
 
 		 610 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  30.59 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  25.07 
 
 		 609 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  21.77 
 
 		 601 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  24.18 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>