More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2153 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  89.1 
 
 
367 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  93.87 
 
 
506 aa  1003    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  85.97 
 
 
506 aa  907    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  100 
 
 
506 aa  1050    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  99.21 
 
 
506 aa  1044    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  82.18 
 
 
506 aa  862    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  83.2 
 
 
506 aa  870    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  90.5 
 
 
506 aa  974    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  83 
 
 
506 aa  868    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  55.42 
 
 
500 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  57.45 
 
 
494 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  47.5 
 
 
517 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  47.83 
 
 
519 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  46.71 
 
 
517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  45.51 
 
 
519 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  45.58 
 
 
519 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  46.31 
 
 
517 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  44.75 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  43.71 
 
 
521 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  41.83 
 
 
507 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  42.48 
 
 
505 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.5 
 
 
506 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  42.71 
 
 
506 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  41.3 
 
 
506 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  39.88 
 
 
503 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  42.38 
 
 
511 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  40.19 
 
 
510 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  39.96 
 
 
517 aa  347  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  41.03 
 
 
517 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  40.12 
 
 
519 aa  344  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  41.23 
 
 
520 aa  343  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  40.74 
 
 
511 aa  333  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  39.11 
 
 
499 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  39.44 
 
 
507 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  37.09 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  37.23 
 
 
521 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  37.07 
 
 
500 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  36.97 
 
 
518 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  37.26 
 
 
508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  36.94 
 
 
483 aa  302  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  35.99 
 
 
501 aa  272  9e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.55 
 
 
505 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0251  flavocytochrome c  85.93 
 
 
161 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  34.87 
 
 
599 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  33.79 
 
 
491 aa  232  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.19 
 
 
609 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  33.21 
 
 
515 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.08 
 
 
515 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  33.02 
 
 
515 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.39 
 
 
584 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  32.22 
 
 
582 aa  207  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.22 
 
 
582 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.76 
 
 
605 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  32.05 
 
 
606 aa  200  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  32.79 
 
 
586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  33.27 
 
 
582 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  31.9 
 
 
603 aa  189  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  30.94 
 
 
586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  33.03 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  33.03 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  33.03 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  33.03 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.08 
 
 
598 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.35 
 
 
596 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  31.42 
 
 
582 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.43 
 
 
597 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  31.42 
 
 
582 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  32.37 
 
 
591 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.13 
 
 
596 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.97 
 
 
596 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.13 
 
 
596 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.27 
 
 
588 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  31.44 
 
 
608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  29.02 
 
 
464 aa  163  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  27.81 
 
 
447 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  31.78 
 
 
596 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.97 
 
 
596 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  31.14 
 
 
596 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.89 
 
 
596 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.33 
 
 
457 aa  156  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.59 
 
 
593 aa  156  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.23 
 
 
598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.69 
 
 
502 aa  154  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.73 
 
 
589 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.83 
 
 
650 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.46 
 
 
583 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.91 
 
 
598 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.99 
 
 
631 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  30.42 
 
 
561 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.94 
 
 
465 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29 
 
 
597 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.3 
 
 
925 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  27.67 
 
 
635 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.06 
 
 
504 aa  140  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  28.75 
 
 
957 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  30.21 
 
 
589 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.14 
 
 
589 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  28.35 
 
 
616 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.54 
 
 
925 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>