58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1990 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 378 aa  787    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  95.49 
 
 		 377 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  98.15 
 
 		 378 aa  773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.4 
 
 		 392 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.26 
 
 		 369 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  52.75 
 
 		 580 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.48 
 
 		 648 aa  352  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  54.19 
 
 		 362 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.92 
 
 		 315 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.29 
 
 		 315 aa  330  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.94 
 
 		 316 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.65 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.48 
 
 		 505 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.2 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.86 
 
 		 314 aa  315  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.55 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.58 
 
 		 426 aa  314  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.23 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.23 
 
 		 316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.91 
 
 		 316 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.91 
 
 		 316 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  47.44 
 
 		 344 aa  299  6e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  46.32 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  45.14 
 
 		 340 aa  292  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.4 
 
 		 333 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.4 
 
 		 333 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  45.19 
 
 		 341 aa  283  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.93 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.58 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.84 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.33 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  33.22 
 
 		 329 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.02 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.34 
 
 		 507 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.13 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.22 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 628 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.56 
 
 		 2073 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.06 
 
 		 607 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  31.38 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  26.36 
 
 		 627 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 634 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 634 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 634 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  30.89 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  30.05 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.03 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  23.37 
 
 		 1278 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.56 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  24.87 
 
 		 710 aa  62.8  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.03 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  24.14 
 
 		 713 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.87 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  22.92 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 512 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>