65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1970 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  100 
 
 		 93 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  100 
 
 		 93 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  98.92 
 
 		 93 aa  190  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  95.7 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  91.4 
 
 		 93 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  91.4 
 
 		 93 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  91.4 
 
 		 93 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  91.4 
 
 		 93 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  90.32 
 
 		 93 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  58.06 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  58.06 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  57.84 
 
 		 102 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  50.54 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000931832  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  51.02 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2133  DsrH family protein  57.97 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0139279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  44.33 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.27 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  35.35 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  39.39 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  38.54 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  38.54 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  38.54 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.42 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  31.96 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  39.18 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  39.18 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  36.46 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  37.5 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  36.46 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  36 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  37.5 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  36.46 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.46 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.42 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  30.93 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  31.63 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  31.96 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  31.63 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  29 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  31.31 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.38 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  31.25 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  30.3 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2454  DsrH family protein  30.84 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000310745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1762  DsrH family protein  38.81 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000150068  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1816  DsrH family protein  38.81 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000616385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  27.84 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0491  sulfur transfer complex subunit TusB  32.65 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.870236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  26.8 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  27.37 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.5 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000040872  normal  0.0520484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000589995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>