176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1865 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1132    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  99.28 
 
 		 554 aa  1125    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  91.52 
 
 		 554 aa  1053    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  50.84 
 
 		 548 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  48.09 
 
 		 548 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  50 
 
 		 547 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  43.99 
 
 		 547 aa  485  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  45.65 
 
 		 548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  44.06 
 
 		 550 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  44.06 
 
 		 550 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  44.06 
 
 		 550 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  44.14 
 
 		 548 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  42.01 
 
 		 548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  42.18 
 
 		 547 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  42.18 
 
 		 547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  41.62 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  41.62 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  41.36 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  41.8 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  41.36 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  41.36 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  41.36 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  41.62 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  41.62 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  41.62 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  41.62 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  41.36 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  41.62 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  41.62 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  42.99 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  42.52 
 
 		 546 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  40.14 
 
 		 545 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  38.99 
 
 		 550 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  38.35 
 
 		 550 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2932  hypothetical protein  39.4 
 
 		 548 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  34.96 
 
 		 554 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  36.19 
 
 		 580 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  33.94 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  33.52 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  33.02 
 
 		 558 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  32.15 
 
 		 556 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  32.95 
 
 		 548 aa  293  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  32.53 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  33.52 
 
 		 546 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  34.03 
 
 		 537 aa  289  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  34.61 
 
 		 539 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  33.33 
 
 		 556 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  31.39 
 
 		 546 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  31 
 
 		 559 aa  282  9e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  34.03 
 
 		 551 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  33.46 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  31.94 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  34.03 
 
 		 551 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  34.23 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  32.32 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  34.23 
 
 		 539 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  34.23 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  34.23 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  34.03 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  34.23 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  34.29 
 
 		 539 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  34.29 
 
 		 539 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  32.42 
 
 		 546 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  30.55 
 
 		 547 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  32.57 
 
 		 544 aa  278  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  32.95 
 
 		 533 aa  276  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  30.18 
 
 		 547 aa  276  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  32.28 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  33.65 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  33.65 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  33.65 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  31.61 
 
 		 531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  31.15 
 
 		 552 aa  273  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  31.41 
 
 		 531 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  31.33 
 
 		 569 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  32.46 
 
 		 552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  32.46 
 
 		 552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  30.92 
 
 		 539 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  31.69 
 
 		 555 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  31.36 
 
 		 531 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  28.7 
 
 		 537 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  32.1 
 
 		 547 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  31.12 
 
 		 545 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  31.56 
 
 		 559 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  32.63 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  32.53 
 
 		 551 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  29.76 
 
 		 547 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  30.15 
 
 		 534 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  33.71 
 
 		 558 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  30.35 
 
 		 559 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  30.88 
 
 		 551 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  28.29 
 
 		 538 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  28.99 
 
 		 561 aa  224  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  28.01 
 
 		 688 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  29.69 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1571  virulence factor MCE-like protein-related protein  29.46 
 
 		 808 aa  203  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.645853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  26.13 
 
 		 694 aa  196  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  33.98 
 
 		 768 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  33.66 
 
 		 768 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2566  hypothetical protein  31.72 
 
 		 879 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.830034  normal  0.124645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>