62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1716 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  93.71 
 
 		 1065 aa  2021    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  100 
 
 		 1065 aa  2207    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  25.99 
 
 		 1090 aa  281  7e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0817  ATPase  30.09 
 
 		 1039 aa  262  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.331244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1037 aa  261  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  30.05 
 
 		 902 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  37.55 
 
 		 1040 aa  251  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  35.34 
 
 		 989 aa  227  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  34.83 
 
 		 1034 aa  218  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  35.52 
 
 		 989 aa  218  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  34.18 
 
 		 1143 aa  209  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  34.26 
 
 		 1097 aa  202  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  33.64 
 
 		 911 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  28.7 
 
 		 930 aa  162  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1887  hypothetical protein  22.46 
 
 		 870 aa  112  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.6 
 
 		 531 aa  63.9  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 533 aa  62  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  33.93 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  24.16 
 
 		 427 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  34.48 
 
 		 600 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  32.35 
 
 		 593 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  27.88 
 
 		 570 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  33.04 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  29.05 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  22.51 
 
 		 590 aa  57.4  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  32.41 
 
 		 563 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.61 
 
 		 664 aa  56.2  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  27.78 
 
 		 603 aa  55.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1698 aa  55.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  28.89 
 
 		 709 aa  55.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  26.55 
 
 		 589 aa  55.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  27.84 
 
 		 616 aa  54.7  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  32.64 
 
 		 561 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  25.64 
 
 		 617 aa  54.3  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  33.01 
 
 		 608 aa  53.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.66 
 
 		 674 aa  53.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  27.45 
 
 		 592 aa  52.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  27.45 
 
 		 589 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  25.36 
 
 		 325 aa  50.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  31.07 
 
 		 611 aa  51.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  25.47 
 
 		 605 aa  50.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  25.95 
 
 		 670 aa  49.7  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  27.82 
 
 		 508 aa  49.7  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.07 
 
 		 560 aa  49.3  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  32.09 
 
 		 709 aa  49.3  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.2 
 
 		 714 aa  48.9  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  28.28 
 
 		 559 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  27.22 
 
 		 601 aa  48.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  24.32 
 
 		 659 aa  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.62 
 
 		 628 aa  47.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  21 
 
 		 557 aa  47.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  34.31 
 
 		 591 aa  47  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  28.23 
 
 		 777 aa  46.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.39 
 
 		 591 aa  46.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.62 
 
 		 564 aa  46.2  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2699  AAA ATPase  27.91 
 
 		 603 aa  45.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.480316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  27.69 
 
 		 496 aa  45.4  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  25.31 
 
 		 572 aa  45.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  30.37 
 
 		 575 aa  45.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  32.04 
 
 		 557 aa  45.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  21 
 
 		 998 aa  44.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.69 
 
 		 550 aa  44.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>