More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1592 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  63.66 
 
 
799 aa  1055  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  96.19 
 
 
789 aa  1579  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  90.1 
 
 
789 aa  1466  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  73.66 
 
 
792 aa  1236  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  89.73 
 
 
790 aa  1470  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.96099e-05  hitchhiker  4.14181e-07 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  74.94 
 
 
792 aa  1258  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  74.94 
 
 
792 aa  1258  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  69.34 
 
 
795 aa  1163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  51.91 
 
 
806 aa  840  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  73.4 
 
 
794 aa  1223  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  95.94 
 
 
789 aa  1558  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  65.69 
 
 
796 aa  1066  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  63.66 
 
 
799 aa  1056  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  51.09 
 
 
803 aa  805  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  65.69 
 
 
798 aa  1074  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  66.24 
 
 
799 aa  1088  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
800 aa  1061  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  90.62 
 
 
789 aa  1452  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.37182e-05  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  69.42 
 
 
791 aa  1168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63384e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  74.94 
 
 
792 aa  1259  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  74.94 
 
 
792 aa  1258  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  73.4 
 
 
794 aa  1223  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  69.29 
 
 
791 aa  1166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  73.4 
 
 
794 aa  1223  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  70.18 
 
 
792 aa  1177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  68.11 
 
 
798 aa  1143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  66.92 
 
 
795 aa  1123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.63208e-07  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  96.19 
 
 
789 aa  1579  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  63.91 
 
 
799 aa  1053  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  66.16 
 
 
784 aa  1078  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  67.94 
 
 
790 aa  1143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  64.67 
 
 
801 aa  1053  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  63.91 
 
 
799 aa  1053  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  65.9 
 
 
796 aa  1082  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  50.38 
 
 
812 aa  796  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  65.36 
 
 
799 aa  1074  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  52.1 
 
 
821 aa  833  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  63.91 
 
 
812 aa  1052  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  63.91 
 
 
799 aa  1053  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  53.15 
 
 
798 aa  850  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  69.42 
 
 
791 aa  1171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6481  phosphoenolpyruvate synthase  50.7 
 
 
811 aa  808  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237379  normal  0.463412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  51.95 
 
 
803 aa  850  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  69.52 
 
 
803 aa  1149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  69.8 
 
 
790 aa  1176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  97.84 
 
 
789 aa  1579  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  74.3 
 
 
792 aa  1256  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  63.49 
 
 
801 aa  1055  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  89.86 
 
 
789 aa  1464  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  63.91 
 
 
799 aa  1053  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  65.27 
 
 
796 aa  1071  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0548  phosphoenolpyruvate synthase  65.86 
 
 
799 aa  1083  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.485187  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  60.66 
 
 
787 aa  1014  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  73.53 
 
 
792 aa  1231  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  74.94 
 
 
792 aa  1257  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  73.37 
 
 
792 aa  1228  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  49.55 
 
 
799 aa  785  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  65.31 
 
 
795 aa  1075  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  64.93 
 
 
797 aa  1062  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  69.59 
 
 
790 aa  1166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  65.9 
 
 
796 aa  1082  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  65.82 
 
 
789 aa  1108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  52.41 
 
 
804 aa  811  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.71715e-09 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  73.66 
 
 
792 aa  1237  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  51.15 
 
 
812 aa  818  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  52.01 
 
 
812 aa  834  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  63.78 
 
 
790 aa  1043  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  46.93 
 
 
760 aa  683  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  58.73 
 
 
786 aa  966  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  64.37 
 
 
810 aa  1063  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  53.4 
 
 
790 aa  869  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  69.58 
 
 
790 aa  1172  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  53.61 
 
 
799 aa  860  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  73.53 
 
 
792 aa  1232  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  53.6 
 
 
803 aa  874  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  54.09 
 
 
839 aa  909  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  62.86 
 
 
800 aa  1043  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  53.74 
 
 
837 aa  904  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  53.19 
 
 
806 aa  861  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  75.06 
 
 
792 aa  1264  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  75.06 
 
 
792 aa  1264  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  67.05 
 
 
792 aa  1115  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  55.4 
 
 
809 aa  894  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  65.24 
 
 
797 aa  1084  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  65.06 
 
 
795 aa  1071  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  63.62 
 
 
801 aa  1053  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  49.55 
 
 
799 aa  785  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  74.68 
 
 
792 aa  1253  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  63.97 
 
 
801 aa  1055  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  74.94 
 
 
792 aa  1262  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  52.77 
 
 
805 aa  841  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  5.80674e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  78.45 
 
 
790 aa  1308  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  52.46 
 
 
803 aa  837  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  52.22 
 
 
793 aa  845  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  53.12 
 
 
832 aa  900  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  54.21 
 
 
839 aa  911  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  96.07 
 
 
789 aa  1576  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  6.30455e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  65.23 
 
 
788 aa  1077  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  74.94 
 
 
792 aa  1258  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  52.46 
 
 
803 aa  837  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>