23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1586 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1661  hypothetical protein  99.61 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100464  unclonable  0.0000162352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.0602505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1730  hypothetical protein  98.46 
 
 		 259 aa  520  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0608955  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2650  hypothetical protein  93.05 
 
 		 259 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2249  hypothetical protein  92.66 
 
 		 259 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2488  hypothetical protein  86.87 
 
 		 259 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1856  hypothetical protein  86.87 
 
 		 259 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0849639  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2608  hypothetical protein  86.87 
 
 		 259 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0307419  decreased coverage  0.000510715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2495  hypothetical protein  86.87 
 
 		 259 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1323  hypothetical protein  77.78 
 
 		 257 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2097  hypothetical protein  78.38 
 
 		 259 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1623  hypothetical protein  77.99 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.0571919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1804  hypothetical protein  72.59 
 
 		 257 aa  384  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389393  hitchhiker  0.0035838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1449  hypothetical protein  75.52 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000835814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2840  hypothetical protein  76.83 
 
 		 257 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0776012  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1536  hypothetical protein  70 
 
 		 258 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0198685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1690  hypothetical protein  33.59 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.278449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01943  hypothetical protein  35.29 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1622  hypothetical protein  31.23 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1199  hypothetical protein  35.37 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1499  hypothetical protein  30.08 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000480676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003884  DNA repair ATPase  31.97 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01792  hypothetical protein  31.05 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>