More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1546 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1857  ATP-dependent protease  89.43 
 
 		 577 aa  1076    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2604  ATP-dependent protease  84.55 
 
 		 577 aa  1029    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000149813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1638  ATP-dependent protease  86.66 
 
 		 577 aa  1053    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00274053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1780  conserved hypothetical ATP-dependent protease  84.2 
 
 		 577 aa  1027    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000100505  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2679  ATP-dependent protease  84.38 
 
 		 577 aa  1028    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0066735  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2564  ATP-dependent protease  84.38 
 
 		 577 aa  1029    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000155632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2149  ATP-dependent protease  57.57 
 
 		 543 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000159451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  66.55 
 
 		 599 aa  789    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000127268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1952  peptidase S16 lon domain-containing protein  56.17 
 
 		 570 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2467  ATP-dependent protease  60.14 
 
 		 580 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00344984  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1546  ATP-dependent protease  100 
 
 		 582 aa  1203    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000113225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1613  ATP-dependent protease  99.48 
 
 		 582 aa  1194    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000299604  normal  0.391845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2655  ATP-dependent protease  67.07 
 
 		 596 aa  799    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1607  ATP-dependent protease  95.7 
 
 		 582 aa  1152    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000644541  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1818  ATP-dependent protease  58.17 
 
 		 569 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1606  ATP-dependent protease  60.1 
 
 		 576 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000440956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  36.49 
 
 		 786 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  37.9 
 
 		 786 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  37.78 
 
 		 818 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  37.34 
 
 		 803 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  36.36 
 
 		 831 aa  312  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  37.93 
 
 		 800 aa  312  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  38.99 
 
 		 829 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  38.4 
 
 		 827 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  39.2 
 
 		 817 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  39.96 
 
 		 806 aa  310  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  39.07 
 
 		 811 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.26 
 
 		 802 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  39.07 
 
 		 811 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  38.99 
 
 		 817 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  38.85 
 
 		 812 aa  306  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.1 
 
 		 816 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  42.22 
 
 		 546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  36.25 
 
 		 844 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  35.91 
 
 		 811 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  35.08 
 
 		 786 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  36.77 
 
 		 807 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  34.01 
 
 		 811 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  35.32 
 
 		 821 aa  299  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  38.75 
 
 		 546 aa  299  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000734026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  38.09 
 
 		 832 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.01 
 
 		 795 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  36.51 
 
 		 809 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  38 
 
 		 812 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  35.21 
 
 		 805 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  38 
 
 		 812 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  38 
 
 		 812 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.02 
 
 		 805 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.02 
 
 		 805 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  38 
 
 		 812 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.15 
 
 		 805 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  40 
 
 		 590 aa  293  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164824  decreased coverage  0.000000603795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  37.22 
 
 		 802 aa  293  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  36.55 
 
 		 799 aa  293  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  39.78 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  39.78 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000294909  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  33.88 
 
 		 814 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  39.78 
 
 		 540 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510666  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  36.72 
 
 		 798 aa  291  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  36.73 
 
 		 815 aa  291  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  33.2 
 
 		 825 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.75 
 
 		 843 aa  291  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.48 
 
 		 806 aa  289  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.27 
 
 		 810 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  36.81 
 
 		 813 aa  286  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  34.05 
 
 		 805 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.1 
 
 		 805 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  34.05 
 
 		 805 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  38.03 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  34.17 
 
 		 806 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.33 
 
 		 807 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  36.2 
 
 		 791 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.05 
 
 		 805 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  34.98 
 
 		 777 aa  283  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  36.44 
 
 		 813 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  34.95 
 
 		 873 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.53 
 
 		 801 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  36.76 
 
 		 803 aa  281  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  35.41 
 
 		 861 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  36.25 
 
 		 810 aa  281  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  34.8 
 
 		 819 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  35.94 
 
 		 660 aa  279  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  36.54 
 
 		 795 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.67 
 
 		 813 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  33.53 
 
 		 817 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.86 
 
 		 865 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  34.86 
 
 		 819 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  41.69 
 
 		 784 aa  276  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1557  putative protease La homolog  37.5 
 
 		 555 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00224903  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  33.4 
 
 		 798 aa  273  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  31.5 
 
 		 823 aa  273  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  32.27 
 
 		 786 aa  272  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 805 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  38.38 
 
 		 809 aa  271  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.73 
 
 		 788 aa  270  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  35.04 
 
 		 814 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  33.53 
 
 		 808 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  34.19 
 
 		 806 aa  270  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  33.94 
 
 		 811 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.78 
 
 		 810 aa  269  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669789  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>