83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1507 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1568  cell division protein ZipA  97.11 
 
 
346 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000509277  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1574  cell division protein ZipA  99.71 
 
 
346 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000216303  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1507  cell division protein ZipA  100 
 
 
346 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000182258  decreased coverage  0.000000000692006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2897  cell division protein ZipA  86.61 
 
 
344 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1704  cell division protein ZipA  75.27 
 
 
368 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000875421  decreased coverage  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2655  cell division protein ZipA  75.82 
 
 
364 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000481866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2759  cell division protein ZipA  75.9 
 
 
356 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000277167  hitchhiker  0.0000636327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2680  cell division protein ZipA  75.9 
 
 
356 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2365  cell division protein ZipA  77.21 
 
 
342 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000198089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2378  cell division protein ZipA  51.2 
 
 
335 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000117796  unclonable  0.00000127891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2848  cell division protein ZipA  53.74 
 
 
311 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000011699  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2462  cell division protein ZipA  50.14 
 
 
352 aa  322  8e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1688  cell division protein ZipA  50.28 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2515  cell division protein ZipA  50.87 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1737  cell division protein ZipA  50.81 
 
 
341 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000116283  hitchhiker  0.00000000149042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1515  cell division protein ZipA  50.28 
 
 
350 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000403723  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2745  cell division protein ZipA  36.31 
 
 
328 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000202555  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1431  cell division protein ZipA  36.31 
 
 
328 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1320  cell division protein ZipA  36.31 
 
 
327 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.80007e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3188  cell division protein ZipA  33.99 
 
 
318 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000114957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3266  cell division protein ZipA  33.79 
 
 
308 aa  173  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1015  cell division protein ZipA  35.14 
 
 
340 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3467  putative cell division protein ZipA  34.47 
 
 
380 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1249  cell division protein ZipA  33.83 
 
 
328 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000496931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1266  cell division protein ZipA  33.83 
 
 
328 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000846548  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2699  cell division protein ZipA  34.53 
 
 
328 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2547  cell division protein ZipA  34.53 
 
 
328 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7392099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02312  cell division protein ZipA  34.53 
 
 
328 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000911583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02273  hypothetical protein  34.53 
 
 
328 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2567  cell division protein ZipA  33.53 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167953  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01849  putative cell division protein ZipA  54.2 
 
 
532 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000720227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1775  cell division protein ZipA  46.41 
 
 
444 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000785839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004154  cell division protein ZipA  31.1 
 
 
318 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000297505  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0778  cell division protein ZipA  53.49 
 
 
336 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000881239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3445  cell division protein ZipA  51.94 
 
 
332 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000760929  decreased coverage  0.0000314053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0371  cell division protein ZipA  27.15 
 
 
335 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2572  cell division protein ZipA  50.39 
 
 
328 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000023932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2621  cell division protein ZipA  50.39 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000442866  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2793  cell division protein ZipA  50.39 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000505214  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2663  cell division protein ZipA  50.39 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000146198  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2768  cell division protein ZipA  45.33 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000420135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2687  cell division protein ZipA  50.39 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000108647  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3643  cell division protein ZipA  45.33 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110035  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2338  cell division protein ZipA  47.29 
 
 
291 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385149  normal  0.0462003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2354  cell division protein ZipA  28.65 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1880  cell division protein ZipA  40.69 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00963367  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0491  cell division protein ZipA  34.43 
 
 
291 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677143  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0067  cell division protein ZipA  49.58 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.218831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3657  cell division protein ZipA, putative  39.13 
 
 
288 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1818  cell division protein ZipA  33.03 
 
 
287 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00237692  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1523  cell division protein  37.65 
 
 
230 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.918664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0654  cell division protein ZipA  37.65 
 
 
225 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3805  cell division protein ZipA  41.09 
 
 
290 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44670  cell division protein ZipA  41.09 
 
 
289 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1800  cell division protein ZipA  39.86 
 
 
288 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000542289  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30300  cell division protein ZipA  38.41 
 
 
285 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00228143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2747  cell division protein ZipA  42.64 
 
 
273 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209511  normal  0.778206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3839  cell division protein ZipA  40.74 
 
 
296 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533942  normal  0.453684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3601  cell division protein ZipA  40.31 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00102901  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4275  cell division protein ZipA  41.09 
 
 
317 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230657  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1593  cell division protein ZipA  41.09 
 
 
297 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.953645  normal  0.0582904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3406  cell division protein ZipA  36.88 
 
 
342 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1166  cell division protein ZipA  37.59 
 
 
338 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00263828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0680  cell division protein ZipA  38.05 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0264468  normal  0.885253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2672  hypothetical protein  38.66 
 
 
259 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0698  cell division protein ZipA  31.85 
 
 
423 aa  86.7  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000137968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2542  hypothetical protein  37.5 
 
 
259 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2025  cell division protein ZipA  37.61 
 
 
267 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0277053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00742  cell division protein ZipA  35.04 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415123  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1694  cell division protein ZipA  34.48 
 
 
298 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000842049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2585  cell division protein ZipA  32.85 
 
 
246 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.808255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2048  cell division protein ZipA  30.34 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2439  cell division protein ZipA, putative  36.97 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.734169  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0319  cell division protein  33.9 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00406721  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0350  putative cell division protein  29.87 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0531871  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1879  cell division protein ZipA  32.23 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1576  cell division protein ZipA  30.36 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2129  cell division protein ZipA  28.38 
 
 
243 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.281961  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0162  cell division protein ZipA  35.34 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2940  cell division protein ZipA  34.48 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000042713  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0468  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  24.29 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  25.64 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01311  cell division protein ZipA  34 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>