29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1469 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  88.51 
 
 
824 aa  1437  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.2798e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  71.74 
 
 
828 aa  1187  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.31771e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  74.88 
 
 
828 aa  1248  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  91.17 
 
 
827 aa  1535  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.15404e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  62.73 
 
 
832 aa  1016  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.05835e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  71.91 
 
 
826 aa  1158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  96.74 
 
 
828 aa  1583  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  5.14631e-09 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  75.3 
 
 
829 aa  1147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  97.71 
 
 
828 aa  1600  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1672  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  8.92624e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  90.93 
 
 
827 aa  1530  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.77581e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  67.06 
 
 
839 aa  1114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  71.74 
 
 
823 aa  1163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  90.81 
 
 
827 aa  1530  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.08466e-06  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  92.74 
 
 
827 aa  1571  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  90.93 
 
 
827 aa  1530  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.60154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  41.64 
 
 
866 aa  572  1e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  34.08 
 
 
856 aa  307  5e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  30.32 
 
 
872 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  28.35 
 
 
796 aa  216  2e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  27.84 
 
 
826 aa  202  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  26.72 
 
 
802 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  27.09 
 
 
993 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  29.17 
 
 
939 aa  66.2  2e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0034  hypothetical protein  27.8 
 
 
975 aa  63.2  2e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272533  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  28.2 
 
 
832 aa  55.1  6e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0048  hypothetical protein  29.48 
 
 
982 aa  52  5e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0036  hypothetical protein  25 
 
 
982 aa  51.6  6e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0033  hypothetical protein  27.49 
 
 
982 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>