121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1434 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  91.98 
 
 
424 aa  818    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  71.33 
 
 
429 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  100 
 
 
429 aa  895    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  99.53 
 
 
429 aa  892    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  70.63 
 
 
454 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  96.5 
 
 
429 aa  865    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  86.25 
 
 
429 aa  784    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  72.1 
 
 
429 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  85.08 
 
 
429 aa  775    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  86.48 
 
 
429 aa  784    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  74.59 
 
 
429 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  72.94 
 
 
433 aa  673    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  86.48 
 
 
429 aa  786    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  74.94 
 
 
431 aa  690    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  86.01 
 
 
429 aa  782    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  65.48 
 
 
439 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  53.98 
 
 
431 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  46.81 
 
 
430 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  47.28 
 
 
463 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  44.21 
 
 
419 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  45.24 
 
 
439 aa  360  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  43.17 
 
 
423 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  43.12 
 
 
428 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 
412 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  41.97 
 
 
421 aa  339  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 
432 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  44.66 
 
 
426 aa  332  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  42.53 
 
 
453 aa  332  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  41.43 
 
 
441 aa  319  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  40.75 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  40.42 
 
 
424 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
488 aa  293  5e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  37.1 
 
 
510 aa  277  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 
439 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 
420 aa  266  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  35.49 
 
 
460 aa  265  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  37.17 
 
 
443 aa  263  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  36.38 
 
 
447 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  32.24 
 
 
478 aa  226  6e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  33.19 
 
 
692 aa  204  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  35.86 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 
527 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  26 
 
 
535 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  26.35 
 
 
535 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
291 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  23.86 
 
 
517 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
305 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 
287 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  29.25 
 
 
521 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
312 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  28.16 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  24.36 
 
 
301 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  25.43 
 
 
539 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  30.71 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  25.57 
 
 
539 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  24.19 
 
 
540 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  25 
 
 
540 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  25.98 
 
 
546 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  28.81 
 
 
533 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  35.71 
 
 
519 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  25 
 
 
545 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  23.7 
 
 
500 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  23.34 
 
 
515 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  27.59 
 
 
323 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  25 
 
 
538 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  24.51 
 
 
549 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  25.56 
 
 
291 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  31.08 
 
 
320 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  23.96 
 
 
504 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  37.68 
 
 
346 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  32.77 
 
 
320 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
335 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  23.72 
 
 
301 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  29.8 
 
 
320 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  33.33 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  29.29 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  23.54 
 
 
511 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  29.17 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  32.09 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  23.72 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  29.41 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  30 
 
 
521 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  30.25 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  34.62 
 
 
328 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5970  prolyl aminopeptidase  29.03 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.0116459 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  23.95 
 
 
513 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  23.72 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  28.33 
 
 
313 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  31.91 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  31.09 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  30.25 
 
 
311 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  28.93 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  27.52 
 
 
328 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  27.86 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  31.51 
 
 
320 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
291 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>