More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1424 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  699  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.83684e-06  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  699  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  3.00384e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  97.93 
 
 
338 aa  691  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  90.24 
 
 
338 aa  646  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  99.7 
 
 
338 aa  699  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.11076e-08  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  95.86 
 
 
338 aa  677  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  4.15846e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  95.86 
 
 
338 aa  677  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.39959e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  95.86 
 
 
338 aa  677  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.59168e-07  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  95.56 
 
 
338 aa  673  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  95.86 
 
 
338 aa  677  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  6.10142e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  90.53 
 
 
338 aa  639  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.21331e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1393  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  88.46 
 
 
338 aa  630  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1650  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  88.46 
 
 
338 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00338188  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1613  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  88.46 
 
 
338 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.86594e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  86.69 
 
 
338 aa  620  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2152  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  88.43 
 
 
338 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.98984e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
338 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.53 
 
 
337 aa  505  1e-142  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.39 
 
 
340 aa  498  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.73 
 
 
338 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.12 
 
 
338 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.77188e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3805  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.06 
 
 
339 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  69.32 
 
 
340 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.75 
 
 
337 aa  491  1e-138  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03103  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.16 
 
 
337 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  66.96 
 
 
340 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.85 
 
 
340 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  64.9 
 
 
340 aa  471  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.9 
 
 
340 aa  466  1e-130  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
340 aa  468  1e-130  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.03 
 
 
340 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.31 
 
 
340 aa  451  1e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.8 
 
 
341 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.42 
 
 
340 aa  438  1e-122  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0940  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.11 
 
 
340 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.281567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.8 
 
 
340 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.8 
 
 
340 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.06 
 
 
342 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.53 
 
 
341 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.38 
 
 
344 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.08 
 
 
344 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
339 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.16797e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 
339 aa  374  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
339 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.0881e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  59.59 
 
 
339 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.71293e-07  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 
339 aa  374  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.82 
 
 
339 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.64 
 
 
339 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  55.03 
 
 
339 aa  371  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.73 
 
 
340 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.44 
 
 
340 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.29 
 
 
349 aa  359  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.56 
 
 
341 aa  357  1e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  54.3 
 
 
348 aa  357  2e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.85 
 
 
351 aa  357  2e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.01 
 
 
349 aa  352  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.73 
 
 
345 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.41 
 
 
341 aa  348  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.54 
 
 
337 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  54.03 
 
 
335 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.2 
 
 
344 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.63 
 
 
348 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.81 
 
 
344 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 
335 aa  343  3e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
344 aa  342  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
344 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
344 aa  337  1e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.9 
 
 
345 aa  337  2e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.99 
 
 
334 aa  337  2e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 
340 aa  336  3e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.45 
 
 
344 aa  336  3e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.45 
 
 
342 aa  336  3e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
344 aa  335  4e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.45 
 
 
344 aa  335  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.6 
 
 
344 aa  335  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.45 
 
 
344 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.81 
 
 
343 aa  335  6e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
344 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
344 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1717  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
347 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.806069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
344 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.4 
 
 
344 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.81 
 
 
340 aa  331  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.5 
 
 
340 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0277  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  51.64 
 
 
340 aa  328  1e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.125695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.4 
 
 
344 aa  327  1e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0319  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.59 
 
 
343 aa  327  2e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.82 
 
 
341 aa  327  2e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
357 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 
340 aa  326  4e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
348 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
349 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
348 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
349 aa  325  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.17 
 
 
348 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.45 
 
 
329 aa  325  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
359 aa  325  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
348 aa  324  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.6 
 
 
332 aa  324  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
348 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.45815e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>