291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1383 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
110 aa  223  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  3.13492e-06  hitchhiker  7.20992e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  97.27 
 
 
110 aa  216  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  95.45 
 
 
110 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.18136e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  95.45 
 
 
110 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.98712e-08  hitchhiker  6.23922e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  95.45 
 
 
110 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.42137e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  95.45 
 
 
110 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  4.16487e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  95.45 
 
 
110 aa  213  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.29003e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  87.27 
 
 
110 aa  194  4e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  87.27 
 
 
110 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  1.15206e-07  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  84.55 
 
 
110 aa  187  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
91 aa  183  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.09142e-09  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
91 aa  183  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.94286e-06  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  80 
 
 
110 aa  182  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  90.11 
 
 
91 aa  171  2e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  89.01 
 
 
91 aa  166  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.29037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  85.87 
 
 
111 aa  162  1e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  59.63 
 
 
110 aa  146  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05955e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 
110 aa  145  2e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  60.55 
 
 
110 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  60.55 
 
 
110 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  60.55 
 
 
110 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  60.55 
 
 
110 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  60.55 
 
 
110 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  57.8 
 
 
111 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  57.8 
 
 
111 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  57.8 
 
 
111 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  57.27 
 
 
110 aa  138  2e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  61.82 
 
 
112 aa  138  2e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1314  preprotein translocase subunit YajC  70.79 
 
 
89 aa  138  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  58.72 
 
 
110 aa  137  5e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  63.74 
 
 
110 aa  133  6e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  58.18 
 
 
112 aa  133  7e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  63.74 
 
 
111 aa  133  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  52.73 
 
 
110 aa  132  2e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3290  preprotein translocase subunit YajC  56.88 
 
 
109 aa  132  2e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  63.33 
 
 
109 aa  130  7e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004366  preprotein translocase subunit YajC  63.33 
 
 
109 aa  130  7e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  55.96 
 
 
111 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  55.96 
 
 
111 aa  123  8e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  53.61 
 
 
109 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  48.62 
 
 
108 aa  107  4e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.08918e-08  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  56.38 
 
 
111 aa  107  7e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  44.04 
 
 
109 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  51.43 
 
 
120 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0598  preprotein translocase subunit YajC  54.13 
 
 
110 aa  102  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  56.67 
 
 
111 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36476e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  56.67 
 
 
111 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  56.67 
 
 
111 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  56.67 
 
 
111 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  54.44 
 
 
111 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  55.56 
 
 
111 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  55.56 
 
 
111 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
107 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  52.22 
 
 
112 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  52.22 
 
 
112 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  44.04 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.98451e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  42 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.00527e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  41.12 
 
 
116 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.75528e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0942  preprotein translocase, YajC subunit  49.45 
 
 
110 aa  94  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.129581  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  46.85 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  43.64 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  43.93 
 
 
111 aa  90.5  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
110 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
110 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  41.82 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  40.74 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1276  protein translocase subunit yajC  44.32 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.42603e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1109  preprotein translocase, YajC subunit  44.32 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0033679  normal  0.183773 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  37.96 
 
 
168 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  51.9 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>