More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1352 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  99.6 
 
 
249 aa  492  1e-138  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.00993e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  98.8 
 
 
249 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2995  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  94.78 
 
 
249 aa  473  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0119952  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1511  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  94.78 
 
 
249 aa  473  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178615  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2866  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  94.78 
 
 
249 aa  473  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.32207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2847  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  94.38 
 
 
249 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  7.62035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  93.57 
 
 
249 aa  469  1e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  84.34 
 
 
249 aa  434  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  2.23089e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  83.13 
 
 
249 aa  427  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  7.95792e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  79.12 
 
 
249 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  80.72 
 
 
249 aa  411  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  80.32 
 
 
249 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.31041e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1445  electron transfer flavoprotein beta-subunit  80.32 
 
 
249 aa  406  1e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0968162  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1169  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 
249 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000191925  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  72.69 
 
 
250 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  72.69 
 
 
250 aa  364  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  72.29 
 
 
249 aa  355  4e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.28 
 
 
271 aa  354  9e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  71.08 
 
 
249 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  71.08 
 
 
249 aa  350  9e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  71.49 
 
 
249 aa  349  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000407  electron transfer flavoprotein beta subunit  68.27 
 
 
250 aa  348  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  71.08 
 
 
249 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.68 
 
 
249 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.28 
 
 
249 aa  345  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.28 
 
 
249 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  69.88 
 
 
249 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  69.88 
 
 
249 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.67 
 
 
256 aa  342  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3160  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.48 
 
 
249 aa  341  6e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.48 
 
 
249 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.48 
 
 
249 aa  340  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0654  electron transfer flavoprotein beta-subunit  71.89 
 
 
249 aa  338  6e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0614  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  65.86 
 
 
249 aa  337  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.347072  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05548  electron transfer flavoprotein subunit beta  68.27 
 
 
249 aa  336  2e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1613  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
250 aa  336  2e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44944  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  335  4e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  333  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3015  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.437148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16410  electron transfer flavoprotein beta subunit  69.48 
 
 
249 aa  330  9e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  66.27 
 
 
249 aa  328  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  328  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  64.66 
 
 
249 aa  328  7e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0532  electron transport flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  327  2e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0527  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  326  2e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240946  hitchhiker  0.00903597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  324  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
250 aa  322  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  320  9e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  320  1e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  320  1e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.86 
 
 
249 aa  320  2e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  320  2e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  319  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  319  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  4e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  4e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  4e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  4e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  318  4e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  4e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  4e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  318  4e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  4e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  4e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  318  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  318  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  318  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  318  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
267 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  317  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  315  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  315  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  63.86 
 
 
249 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  315  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.85 
 
 
253 aa  314  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  314  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  314  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  62.85 
 
 
253 aa  314  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  64.26 
 
 
249 aa  314  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  313  1e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  313  2e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  63.45 
 
 
249 aa  313  2e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  313  2e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  312  3e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  312  3e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  312  3e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  312  4e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  311  5e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  311  8e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  63.05 
 
 
249 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  63.45 
 
 
249 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>