More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1307 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  100 
 
 		 164 aa  328  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  328  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  328  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  328  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  98.17 
 
 		 164 aa  321  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  97.56 
 
 		 164 aa  320  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  97.56 
 
 		 164 aa  320  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  97.56 
 
 		 164 aa  320  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  97.56 
 
 		 164 aa  320  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  95.73 
 
 		 164 aa  315  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  95.65 
 
 		 164 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  93.9 
 
 		 164 aa  306  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  92.45 
 
 		 163 aa  295  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  88.41 
 
 		 164 aa  294  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  90.68 
 
 		 163 aa  292  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  93.55 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  78.05 
 
 		 164 aa  259  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  78.34 
 
 		 161 aa  259  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  77.44 
 
 		 163 aa  254  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  76.22 
 
 		 164 aa  254  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  77.56 
 
 		 159 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  76.92 
 
 		 159 aa  253  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  77.92 
 
 		 159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  77.92 
 
 		 159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  77.92 
 
 		 159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  77.92 
 
 		 159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  77.27 
 
 		 159 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  78.95 
 
 		 164 aa  248  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  78.95 
 
 		 164 aa  247  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  72.56 
 
 		 174 aa  247  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  77.33 
 
 		 161 aa  244  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  76.32 
 
 		 162 aa  243  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  81.12 
 
 		 159 aa  239  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  76.67 
 
 		 164 aa  238  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  79.02 
 
 		 159 aa  236  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  69.74 
 
 		 163 aa  224  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  67.97 
 
 		 159 aa  214  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  61.25 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  67.63 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  56.71 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3228  putative CheW protein  60.45 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000337303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  42.66 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  42.48 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  42.28 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  40.82 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  40.82 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  37.84 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  40.49 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  40.69 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  38.46 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  40.69 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  43.07 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  40.27 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  38.51 
 
 		 163 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.67 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  36.99 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  35.67 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  43.31 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.26 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  40.71 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  39.58 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  37.84 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  37.24 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  42.31 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.88 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  37.67 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  37.58 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  47.22 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  37.76 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  40.56 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  40.56 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  39.74 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  42.31 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.59 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  35.86 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.81 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  39.72 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  37.93 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  39.58 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  43.42 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  37.67 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  38.12 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.13 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  36.25 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  36.94 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  34.42 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.13 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  36.25 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  34.42 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  34.42 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  34.42 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  38.06 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.17 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.17 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  38.62 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  39.6 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>