149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1284 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 316 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  99.68 
 
 		 316 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  90.94 
 
 		 320 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  84.23 
 
 		 316 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  71.65 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  71.97 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  67.61 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  67.92 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  67.92 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  54.74 
 
 		 334 aa  329  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  52.8 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  55.21 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  56.85 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  51.06 
 
 		 316 aa  281  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  50.2 
 
 		 375 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  48.64 
 
 		 300 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  35.25 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  32.66 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  36.33 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  35.83 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  31.08 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  32.26 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  31.58 
 
 		 262 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  34.76 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  37.06 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.83 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  33.13 
 
 		 228 aa  99  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  32.52 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  32.37 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  31.29 
 
 		 228 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 		 228 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 		 228 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 		 228 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 		 228 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  31.69 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  27.36 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  28.96 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  29.44 
 
 		 251 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  31.28 
 
 		 245 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.47 
 
 		 233 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  29.71 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  29.19 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  33.88 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  27.01 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  27.01 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  28.89 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  29.27 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  25.1 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  29.29 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  29.29 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  27.47 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  28.65 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  28.65 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  28.65 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  29.41 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  29.63 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  28.79 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  29.65 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  27.33 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  28.64 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  28.8 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  29.76 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  27.05 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  25.57 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  28.19 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  29.03 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  23.4 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  26.47 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.63 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  28.5 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  28.95 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  30.16 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  26.16 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  26.16 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  26.62 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  25.68 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  24.58 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  25.41 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  25.44 
 
 		 207 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 226 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  25.54 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  26.52 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  29.26 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  23.46 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>