More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1238 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_08121  phosphoribosylformylglycinamidine synthase (Eurofung)  51.01 
 
 		 1360 aa  1268    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0219218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.83 
 
 		 1295 aa  1909    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1111  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.91 
 
 		 1295 aa  1909    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.503937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  68.77 
 
 		 1296 aa  1894    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.1 
 
 		 1214 aa  673    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.75 
 
 		 1295 aa  1906    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1037  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.23 
 
 		 1299 aa  1779    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.76 
 
 		 1234 aa  686    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  83.45 
 
 		 1293 aa  2265    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3368  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.32 
 
 		 1356 aa  1449    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0673  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.19 
 
 		 1288 aa  1526    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0903216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66 
 
 		 1299 aa  1771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1722  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.88 
 
 		 1369 aa  1416    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.166635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  94.51 
 
 		 1293 aa  2546    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3675  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  68.77 
 
 		 1323 aa  1904    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.08 
 
 		 1299 aa  1773    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2196  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.16 
 
 		 1299 aa  1460    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0353893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  96.21 
 
 		 1293 aa  2583    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.1 
 
 		 1298 aa  1782    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41441  predicted protein  38.23 
 
 		 1348 aa  794    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1210  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.32 
 
 		 1356 aa  1449    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3042  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.83 
 
 		 1295 aa  1912    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.631936  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1446  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.36 
 
 		 1353 aa  1449    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.13 
 
 		 1298 aa  1798    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.29 
 
 		 1296 aa  1920    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03300  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  53.19 
 
 		 1355 aa  1334    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  65.87 
 
 		 1298 aa  1782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0187  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.22 
 
 		 1342 aa  1293    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0359438  normal  0.315795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1925  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  57.27 
 
 		 1309 aa  1531    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.741982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  94.12 
 
 		 1293 aa  2536    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1390  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.52 
 
 		 1348 aa  1464    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.91 
 
 		 1295 aa  1909    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  56.63 
 
 		 1318 aa  1462    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.385038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1915  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.51 
 
 		 1360 aa  1382    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0662626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2463  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.39 
 
 		 1366 aa  1451    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1907  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.24 
 
 		 1300 aa  1556    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.819061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.2 
 
 		 1298 aa  1783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2303  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.39 
 
 		 1356 aa  1451    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4851  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.25 
 
 		 1342 aa  1384    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5215  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.77 
 
 		 1354 aa  1455    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903244  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.83 
 
 		 1295 aa  1909    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.99 
 
 		 1354 aa  1462    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.81 
 
 		 1292 aa  1576    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.11 
 
 		 1345 aa  1425    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  59.61 
 
 		 1303 aa  1549    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0770  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.01 
 
 		 1334 aa  1310    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.61 
 
 		 1414 aa  1456    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.077761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  70.42 
 
 		 1298 aa  1914    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  71.94 
 
 		 1297 aa  1957    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  94.28 
 
 		 1293 aa  2538    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2342  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.27 
 
 		 1359 aa  1448    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.48 
 
 		 1217 aa  666    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.23 
 
 		 1306 aa  1404    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2420  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.04 
 
 		 1409 aa  1342    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.466313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1478  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  62.7 
 
 		 1290 aa  1660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.704135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0887  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  62.91 
 
 		 1297 aa  1675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.723631  normal  0.152972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  62.91 
 
 		 1297 aa  1675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.691953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.38 
 
 		 1375 aa  1317    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2283  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.34 
 
 		 1361 aa  1440    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  83.91 
 
 		 1293 aa  2288    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  62.34 
 
 		 1299 aa  1664    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1253  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  68.77 
 
 		 1296 aa  1894    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  62.82 
 
 		 1313 aa  1636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0208  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.44 
 
 		 1345 aa  1296    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1870  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.85 
 
 		 1348 aa  1447    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.395748 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0002  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  60.48 
 
 		 1297 aa  1637    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.15 
 
 		 1299 aa  1775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3609  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.37 
 
 		 1333 aa  1290    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.818183  normal  0.666122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6165  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.4 
 
 		 1354 aa  1447    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.38 
 
 		 1296 aa  1407    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3113  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  70.83 
 
 		 1295 aa  1913    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1761  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.91 
 
 		 1336 aa  1372    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.219026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.5 
 
 		 1231 aa  686    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209803  normal  0.519263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.4 
 
 		 1354 aa  1448    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.11 
 
 		 1345 aa  1431    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  67.08 
 
 		 1297 aa  1822    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 1293 aa  2669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  99.54 
 
 		 1293 aa  2659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2474  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  60.74 
 
 		 1295 aa  1595    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  85.23 
 
 		 1293 aa  2326    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.1 
 
 		 1354 aa  1446    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0378241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15740  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.05 
 
 		 1298 aa  1792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.989806  hitchhiker  0.000000174992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1832  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.06 
 
 		 1357 aa  1442    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.875637 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75569  5'-phosphoribosylformyl glycinamidine synthetase  51.45 
 
 		 1343 aa  1321    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0273535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  93.97 
 
 		 1293 aa  2534    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  84.92 
 
 		 1293 aa  2305    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1914  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.4 
 
 		 1354 aa  1447    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  60.9 
 
 		 1295 aa  1594    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  99.54 
 
 		 1293 aa  2658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2842  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.83 
 
 		 1295 aa  1910    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  83.06 
 
 		 1293 aa  2267    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  65.74 
 
 		 1298 aa  1784    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  85.46 
 
 		 1293 aa  2303    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.41 
 
 		 1341 aa  1312    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3318  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  69.91 
 
 		 1297 aa  1872    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  84.84 
 
 		 1293 aa  2291    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  65.18 
 
 		 1301 aa  1753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3623  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  68.7 
 
 		 1296 aa  1893    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3099  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.82 
 
 		 1347 aa  1354    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1821  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.4 
 
 		 1340 aa  1318    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.965917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>