More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1223 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  83.13 
 
 		 581 aa  1011    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  92.28 
 
 		 583 aa  1118    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  60.03 
 
 		 581 aa  716    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  83.13 
 
 		 581 aa  1010    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  61.57 
 
 		 592 aa  743    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  61.03 
 
 		 586 aa  697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  83.48 
 
 		 581 aa  1013    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  58.32 
 
 		 580 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  100 
 
 		 583 aa  1197    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  84.19 
 
 		 581 aa  1021    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  98.46 
 
 		 583 aa  1182    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  59.38 
 
 		 578 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  98.46 
 
 		 583 aa  1183    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  82.62 
 
 		 580 aa  1003    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  57.44 
 
 		 573 aa  690    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  61.22 
 
 		 577 aa  717    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  44.07 
 
 		 580 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  43.04 
 
 		 585 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  42.5 
 
 		 578 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  39.01 
 
 		 579 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  32.46 
 
 		 664 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.48 
 
 		 523 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  30.84 
 
 		 581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  28.71 
 
 		 529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  29.03 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  28.17 
 
 		 526 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  29.05 
 
 		 558 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.15 
 
 		 663 aa  203  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.16 
 
 		 607 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  27.73 
 
 		 663 aa  200  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  27.29 
 
 		 625 aa  200  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.24 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.81 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.61 
 
 		 601 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.64 
 
 		 627 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.18 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.91 
 
 		 607 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.36 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  28.33 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.76 
 
 		 605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.98 
 
 		 657 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.43 
 
 		 584 aa  181  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.83 
 
 		 659 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  25.53 
 
 		 637 aa  176  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  25.59 
 
 		 637 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.64 
 
 		 672 aa  175  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.79 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.38 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  24.91 
 
 		 641 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.89 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 582 aa  156  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  25.94 
 
 		 619 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.98 
 
 		 508 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  23.89 
 
 		 523 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  23.53 
 
 		 515 aa  114  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.32 
 
 		 489 aa  110  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.5 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.23 
 
 		 509 aa  99.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.35 
 
 		 1215 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.77 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.85 
 
 		 1202 aa  97.4  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  24.17 
 
 		 504 aa  97.4  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.05 
 
 		 1284 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  33.98 
 
 		 315 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.05 
 
 		 1181 aa  94  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.25 
 
 		 512 aa  92.8  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  22.43 
 
 		 556 aa  90.5  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.46 
 
 		 1175 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  29.13 
 
 		 313 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  21.59 
 
 		 533 aa  87  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.54 
 
 		 722 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  29.37 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  21.33 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  30.45 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.22 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  21.8 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  20.85 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.45 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.45 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  21.04 
 
 		 523 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  20.86 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  20.86 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  20.86 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  26.88 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  21.47 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  22.82 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1253  metallophosphoesterase  24.32 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00126646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2912  metallophosphoesterase  25.66 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1194  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  29.44 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000521258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  19.8 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.86 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.44 
 
 		 549 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  23.01 
 
 		 597 aa  72.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.7 
 
 		 549 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  20.84 
 
 		 529 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 638 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  28.12 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.07 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3060  metallophosphoesterase  25.26 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  20.84 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>