66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1182 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1253  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  218  2e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  7.38025e-06  normal  0.482824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1183  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  218  2e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.66643e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1182  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  218  2e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.92062e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3366  hypothetical protein  95.37 
 
 
108 aa  211  2e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2698  hypothetical protein  93.46 
 
 
108 aa  206  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1327  hypothetical protein  91.59 
 
 
108 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00305536  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3051  hypothetical protein  91.59 
 
 
108 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000531694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3037  hypothetical protein  91.59 
 
 
108 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00372208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3194  hypothetical protein  91.59 
 
 
108 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102444  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2696  hypothetical protein  75.93 
 
 
108 aa  172  1e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.386923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2488  hypothetical protein  80.37 
 
 
108 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.516782  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2871  hypothetical protein  77.57 
 
 
108 aa  154  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1221  hypothetical protein  76.6 
 
 
107 aa  147  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000118291  normal  0.537275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1125  hypothetical protein  73.4 
 
 
107 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00669811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1321  hypothetical protein  73.12 
 
 
107 aa  141  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.225531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1110  hypothetical protein  71.3 
 
 
108 aa  141  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.73237e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3392  hypothetical protein  57.01 
 
 
108 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3102  hypothetical protein  57.01 
 
 
108 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3120  hypothetical protein  57.01 
 
 
108 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0755  hypothetical protein  57.01 
 
 
108 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3304  hypothetical protein  57.01 
 
 
108 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0736  protein of unknown function DUF469  57.01 
 
 
108 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02752  hypothetical protein  57.01 
 
 
108 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0018513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02789  hypothetical protein  57.01 
 
 
108 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00171034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4263  hypothetical protein  56.07 
 
 
108 aa  130  7e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.479777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3272  hypothetical protein  54.21 
 
 
108 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3356  hypothetical protein  54.21 
 
 
108 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.511055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3348  hypothetical protein  54.21 
 
 
108 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3451  hypothetical protein  54.21 
 
 
108 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.503448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3282  hypothetical protein  55.14 
 
 
108 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0610455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0148  hypothetical protein  57.94 
 
 
108 aa  129  2e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  hitchhiker  5.5934e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0822  hypothetical protein  57.94 
 
 
108 aa  129  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.296025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0821  hypothetical protein  57.94 
 
 
108 aa  129  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4041  hypothetical protein  55.14 
 
 
108 aa  127  4e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0415023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0884  hypothetical protein  53.27 
 
 
114 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3204  hypothetical protein  49.53 
 
 
114 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3364  hypothetical protein  54.81 
 
 
107 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574157 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3405  hypothetical protein  50.47 
 
 
114 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00230899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4147  hypothetical protein  47.66 
 
 
112 aa  113  8e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3024  hypothetical protein  45.79 
 
 
114 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.628409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1661  hypothetical protein  42.06 
 
 
112 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  3.30236e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2315  hypothetical protein  44.04 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2112  hypothetical protein  44.04 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216997  normal  0.224455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1791  hypothetical protein  44.95 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1611  hypothetical protein  43.12 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0388695  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3640  hypothetical protein  43.12 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0961434  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2099  hypothetical protein  43.12 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543724  normal  0.0806455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1618  hypothetical protein  43.12 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3007  hypothetical protein  42.2 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  6.97819e-10 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2092  hypothetical protein  40.37 
 
 
114 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24700  hypothetical protein  40.37 
 
 
114 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1799  protein of unknown function DUF469  37.96 
 
 
112 aa  67.4  6e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2000  hypothetical protein  37.96 
 
 
112 aa  67.4  6e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.267293  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3336  hypothetical protein  34.82 
 
 
110 aa  58.9  2e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0686  hypothetical protein  34.82 
 
 
110 aa  58.9  2e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0976  hypothetical protein  32.11 
 
 
111 aa  53.5  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3653  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  52.4  2e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2340  hypothetical protein  31.86 
 
 
129 aa  51.2  5e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2219  hypothetical protein  31.86 
 
 
111 aa  50.8  6e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1954  hypothetical protein  35.85 
 
 
112 aa  50.4  8e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5643  hypothetical protein  30.09 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1301  hypothetical protein  33.94 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2302  hypothetical protein  29.2 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1690  hypothetical protein  29.2 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2325  hypothetical protein  29.2 
 
 
111 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227991  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0789  hypothetical protein  34.55 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>