79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1089 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  94.01 
 
 		 217 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  93.09 
 
 		 217 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  81.11 
 
 		 221 aa  349  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  67.15 
 
 		 230 aa  284  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  67.63 
 
 		 230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  66.05 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  66.67 
 
 		 230 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  65.58 
 
 		 233 aa  268  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  49.52 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  49.52 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  50.49 
 
 		 216 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  48.51 
 
 		 242 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  47.83 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  47.37 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  47.6 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  46.89 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  42.58 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  42.58 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  42.58 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  45.93 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  44.29 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  43.06 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  48.15 
 
 		 256 aa  164  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  42.16 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  33.83 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  33.17 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  30.88 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.79 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  31.63 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  31.63 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  31.63 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  31.63 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  31.63 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  31.63 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  31.63 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  30.11 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  31.86 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  31.86 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  31.28 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  29.32 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  37.98 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  33.87 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  27.07 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  25.26 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  29.74 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  29.41 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  26.13 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  26.42 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  29.47 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  27.23 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  24.73 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  25.28 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  21.05 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  27.57 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  25.13 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  23.96 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  25.25 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  27.6 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  27.78 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  27.69 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  22.53 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  25.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  22.53 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  23.74 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  22.16 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  22.16 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  23.24 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  21.55 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  22.7 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  22.16 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>