More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1000 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  85.44 
 
 		 524 aa  825    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  66.73 
 
 		 537 aa  705    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  93.41 
 
 		 518 aa  933    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  72.6 
 
 		 515 aa  698    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  68.93 
 
 		 511 aa  692    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  85.44 
 
 		 524 aa  831    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  85.63 
 
 		 524 aa  826    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  71 
 
 		 519 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  64.97 
 
 		 541 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  85.44 
 
 		 524 aa  824    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 516 aa  1045    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  97.3 
 
 		 519 aa  967    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  70.12 
 
 		 520 aa  691    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  97.87 
 
 		 516 aa  971    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  86.75 
 
 		 518 aa  877    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  69.14 
 
 		 511 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  48.34 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  48.71 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  49.51 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  48.53 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  46.51 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  46.33 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  45.77 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  44.92 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  44.57 
 
 		 509 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  44.09 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  44.42 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  43.69 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  42.55 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  42.55 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  42.55 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  42.67 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  42.67 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  42.67 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  42.64 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  42.67 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  42.15 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  42.45 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  41.95 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  41.95 
 
 		 512 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  41.95 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  41.76 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  41.57 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  41.76 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  43.85 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  41.95 
 
 		 512 aa  352  7e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  42.5 
 
 		 508 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  38.95 
 
 		 510 aa  346  6e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  39.55 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  40.15 
 
 		 514 aa  334  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  39.76 
 
 		 505 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  39.55 
 
 		 505 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  39.55 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  42.68 
 
 		 507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  40.16 
 
 		 505 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  36.81 
 
 		 523 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  39.64 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  37.58 
 
 		 507 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  39.44 
 
 		 506 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  35.15 
 
 		 521 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  36.09 
 
 		 504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  40.12 
 
 		 489 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  36.08 
 
 		 524 aa  293  7e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  36.53 
 
 		 524 aa  292  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  37.23 
 
 		 487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  35.7 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  34.38 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  38.32 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  35.85 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  36.01 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  34.92 
 
 		 522 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  35.66 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  38.38 
 
 		 511 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0678  apolipoprotein N-acyltransferase  35.26 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  38.38 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  34.8 
 
 		 488 aa  264  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  34.13 
 
 		 505 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09030  apolipoprotein N-acyltransferase  39.45 
 
 		 516 aa  263  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  35.25 
 
 		 520 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 		 503 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 		 503 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  32.36 
 
 		 509 aa  250  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  34.06 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  34.84 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  37.13 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  34.81 
 
 		 523 aa  239  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  34.81 
 
 		 523 aa  239  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  33.54 
 
 		 523 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  32.09 
 
 		 500 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  31.39 
 
 		 564 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  32.41 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  33.79 
 
 		 509 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1302  hypothetical protein  30.51 
 
 		 511 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  31.63 
 
 		 524 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  32.73 
 
 		 521 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1303  hypothetical protein  29.07 
 
 		 511 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  30.12 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 		 507 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1862  apolipoprotein N-acyltransferase  29.75 
 
 		 503 aa  210  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>