More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0968 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1144  methyl-accepting chemotaxis protein  90.06 
 
 
362 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
362 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.17 
 
 
362 aa  733    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.93 
 
 
362 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.66 
 
 
362 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.66 
 
 
362 aa  620  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655525  hitchhiker  0.0000230906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3522  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.66 
 
 
362 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2936  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.89 
 
 
362 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0970  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.11 
 
 
362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3185  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.27 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.04 
 
 
362 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  49.3 
 
 
367 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04747  methyl-accepting chemotaxis protein  46.52 
 
 
361 aa  328  7e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  44.85 
 
 
362 aa  314  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.75 
 
 
361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3390  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.55 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.927334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3320  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.55 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.781767  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3310  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.55 
 
 
352 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.740696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3483  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.55 
 
 
352 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3384  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.55 
 
 
352 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644477  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03785  methyl-accepting chemotaxis protein  35.29 
 
 
360 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
372 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.63 
 
 
366 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
442 aa  156  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 
720 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.77 
 
 
720 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 
421 aa  135  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.29 
 
 
658 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 
635 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 
440 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 
483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  32.62 
 
 
365 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  28.92 
 
 
365 aa  122  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  28.65 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.29 
 
 
632 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
483 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.07 
 
 
700 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  35.84 
 
 
375 aa  116  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 
700 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  30.32 
 
 
645 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 
674 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.25 
 
 
622 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00784755  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 
452 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133682  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.39 
 
 
815 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1836  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.48 
 
 
359 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126283  normal  0.522282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 
356 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 
357 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  43.8 
 
 
626 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  39.05 
 
 
458 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  29.44 
 
 
361 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  41.5 
 
 
632 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  41.5 
 
 
632 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  36.05 
 
 
360 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.74 
 
 
501 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  41.5 
 
 
629 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  41.5 
 
 
629 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  41.5 
 
 
629 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.18 
 
 
478 aa  103  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  41.5 
 
 
629 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  46.61 
 
 
587 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 
574 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1954  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 
504 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290306  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  38.24 
 
 
545 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  30.58 
 
 
306 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  42.28 
 
 
661 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 
433 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  47.46 
 
 
488 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.4 
 
 
539 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  56.99 
 
 
476 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.4 
 
 
539 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  55.91 
 
 
480 aa  99.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  42.52 
 
 
629 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  38.89 
 
 
545 aa  99.4  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  42.54 
 
 
547 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  41.1 
 
 
418 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001528  putative chemotaxis transducer  44.17 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
687 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.08 
 
 
621 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 
639 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4907  PAS  39.29 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 
664 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  36.7 
 
 
542 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 
664 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
437 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.43 
 
 
655 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1016  methyl-accepting chemotaxis protein  52.63 
 
 
563 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  32.34 
 
 
543 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 
502 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 
500 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  39.33 
 
 
521 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.33 
 
 
521 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
521 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
640 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 
532 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2179  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
620 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>