21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0920 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  91.72 
 
 		 302 aa  577  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  92.05 
 
 		 302 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  72.15 
 
 		 298 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  50.32 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.03339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0418  hypothetical protein  55.81 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000826848  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  34.94 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  28.12 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  28.12 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  27.69 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  26.58 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  25.61 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  25.32 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  25.7 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  23.86 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  23.57 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  21.71 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  21.28 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>