46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0870 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0870  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3152  curli production assembly/transport component CsgG  99.63 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3253  curli production assembly/transport component CsgG  97.01 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3685  curli production assembly/transport component CsgG, putative  93.26 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1038  curli production assembly/transport component CsgG  91.39 
 
 		 268 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1026  Curli production assembly/transport component CsgG  91.39 
 
 		 268 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3334  curli production assembly/transport component CsgG  91.39 
 
 		 268 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1005  curli production assembly/transport component CsgG  91.01 
 
 		 268 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2984  curli production assembly/transport component CsgG  93.95 
 
 		 268 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0971  curli production assembly/transport component CsgG  84.8 
 
 		 265 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2857  curli production assembly/transport component CsgG, putative  79.38 
 
 		 261 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.680035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0643  curli production assembly/transport component CsgG  76.71 
 
 		 255 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01506  putative transport protein for curli synthesis  58.89 
 
 		 253 aa  298  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1820  curli production assembly/transport component CsgG  51.19 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1520  curli production assembly/transport component CsgG  49.21 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.301126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1729  curli production assembly/transport component CsgG  47.45 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1993  curli production assembly/transport component CsgG  48.09 
 
 		 286 aa  228  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00606032  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1416  curli production assembly/transport subunit CsgG  45.9 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0591449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  45.52 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  45.52 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  45.52 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  45.52 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  45.52 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  45.52 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1155  curli production assembly/transport subunit CsgG  45.15 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2351  curli production assembly/transport component CsgG  47.24 
 
 		 454 aa  221  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3472  curli production assembly/transport component CsgG  48.48 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2299  curli production assembly/transport component CsgG  48.3 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2474  curli production assembly/transport component CsgG  48.26 
 
 		 283 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2465  curli production assembly/transport component CsgG  47.92 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2588  curli production assembly/transport component CsgG  46.67 
 
 		 312 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1235  curli production assembly/transport component CsgG  46.22 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.947173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2234  curli production assembly/transport component CsgG  46.22 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.734266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2051  curli production assembly/transport component CsgG  46.22 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.351157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1205  curli production assembly/transport component CsgG  46.22 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1250  curli production assembly/transport component CsgG  46.22 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.589697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4730  Curli production assembly/transport component CsgG  45.27 
 
 		 478 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1553  curli production assembly/transport component CsgG  45.31 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.301914  normal  0.209181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6061  Curli production assembly/transport component CsgG  44.09 
 
 		 476 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3754  Curli production assembly/transport component CsgG  39.04 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2419  curli production assembly/transport component CsgG  41.63 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0030  Curli production assembly/transport component CsgG  41.47 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1276  curli production assembly/transport component CsgG  40 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2732  putative curli production assembly/transport component csgg precursor  36.86 
 
 		 313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1066  curli production assembly/transport component CsgG  26.48 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6349  Putative protein involved in formation of curli polymers-like protein  25.47 
 
 		 467 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>