183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0796 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
241 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
241 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  94.19 
 
 
241 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  94.19 
 
 
241 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  94.19 
 
 
241 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  94.19 
 
 
241 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  89.21 
 
 
241 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  97.1 
 
 
241 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  97.1 
 
 
241 aa  453  1e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.49 
 
 
245 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  71.37 
 
 
251 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  72.5 
 
 
242 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  71.43 
 
 
241 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  72.8 
 
 
241 aa  363  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  66.8 
 
 
242 aa  354  6e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.86403e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  69.17 
 
 
242 aa  345  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.34 
 
 
240 aa  244  7e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.51 
 
 
261 aa  234  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  51.71 
 
 
238 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  52 
 
 
238 aa  228  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.33 
 
 
236 aa  225  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.33 
 
 
237 aa  224  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.89 
 
 
236 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.67 
 
 
238 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  48.89 
 
 
236 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.89 
 
 
236 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  48.89 
 
 
236 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.89 
 
 
236 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  48.89 
 
 
236 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.23 
 
 
238 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.23 
 
 
238 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.23 
 
 
238 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.89 
 
 
236 aa  222  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.44 
 
 
236 aa  222  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  221  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  221  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  221  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  221  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.72 
 
 
239 aa  221  1e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
238 aa  219  2e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.79 
 
 
251 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.94 
 
 
264 aa  211  8e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  43.67 
 
 
258 aa  197  2e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  43.53 
 
 
232 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  45 
 
 
272 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  43.98 
 
 
245 aa  191  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.01453e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  44.12 
 
 
244 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.92 
 
 
262 aa  188  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.63 
 
 
246 aa  184  2e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  44.9 
 
 
241 aa  181  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  44.73 
 
 
246 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.21 
 
 
210 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  42.19 
 
 
244 aa  178  6e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.16 
 
 
250 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  41.88 
 
 
238 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.98401e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.18 
 
 
247 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.73 
 
 
260 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.73 
 
 
247 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.44 
 
 
253 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.16 
 
 
241 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  37.28 
 
 
262 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.92 
 
 
242 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.56 
 
 
242 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  5.49688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  40.17 
 
 
243 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  40.74 
 
 
262 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.21 
 
 
245 aa  163  2e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  42.64 
 
 
263 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  42.41 
 
 
265 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.1 
 
 
242 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  35.42 
 
 
245 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.82 
 
 
264 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  38.03 
 
 
254 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  37.25 
 
 
237 aa  139  4e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  39.59 
 
 
277 aa  134  2e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  35.02 
 
 
255 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  36.54 
 
 
285 aa  127  2e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  44.36 
 
 
285 aa  118  8e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  37.58 
 
 
179 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  34.11 
 
 
246 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  37.78 
 
 
178 aa  98.6  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  30.94 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.63 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  31.62 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.98 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  28.98 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  30.54 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.77 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  30.43 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  30.13 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  30.43 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.29 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.65 
 
 
240 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.23 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  29.07 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  36.3 
 
 
187 aa  85.5  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.11 
 
 
236 aa  85.5  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  28.81 
 
 
235 aa  84.3  1e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  25.69 
 
 
238 aa  85.1  1e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.37 
 
 
246 aa  83.6  3e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>