50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0721 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  89.24 
 
 
502 aa  865  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  100 
 
 
502 aa  969  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  80.48 
 
 
496 aa  763  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  79.48 
 
 
496 aa  767  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  78.09 
 
 
496 aa  758  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  98.8 
 
 
502 aa  958  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  80.68 
 
 
496 aa  764  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  80.68 
 
 
496 aa  765  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  57.26 
 
 
500 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  55.51 
 
 
503 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  2.77194e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  55.67 
 
 
498 aa  493  1e-138  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  41.65 
 
 
451 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  34.63 
 
 
483 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  31.78 
 
 
552 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  28.61 
 
 
481 aa  77  7e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.13 
 
 
453 aa  75.9  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  27.59 
 
 
627 aa  74.3  4e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  27.19 
 
 
517 aa  69.7  1e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  26.33 
 
 
498 aa  65.1  2e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  35.8 
 
 
170 aa  65.1  3e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  26.75 
 
 
392 aa  64.7  4e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  28.54 
 
 
434 aa  60.8  5e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  28.7 
 
 
444 aa  60.5  8e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.9 
 
 
415 aa  60.1  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  34.64 
 
 
183 aa  58.5  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  26.23 
 
 
481 aa  57.4  5e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  28.94 
 
 
314 aa  56.6  1e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  28.4 
 
 
241 aa  55.5  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  38.2 
 
 
144 aa  54.7  4e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  32.38 
 
 
139 aa  51.6  3e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  30.47 
 
 
190 aa  52  3e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  31.43 
 
 
144 aa  51.2  4e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  24.68 
 
 
483 aa  51.2  4e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  33.33 
 
 
139 aa  50.1  9e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  31.43 
 
 
139 aa  50.1  9e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  28.57 
 
 
139 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  31.43 
 
 
139 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  37.08 
 
 
139 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  36.05 
 
 
139 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  36.05 
 
 
139 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  33.33 
 
 
139 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  38.78 
 
 
142 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  31.21 
 
 
564 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  33.9 
 
 
143 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.39477e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  30.83 
 
 
183 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  30.51 
 
 
154 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  29.55 
 
 
214 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  26.27 
 
 
457 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  36.45 
 
 
163 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  28.08 
 
 
578 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>