26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0693 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0844  hypothetical protein  88.57 
 
 
389 aa  716  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3158  hypothetical protein  88.31 
 
 
384 aa  711  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0013201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3523  hypothetical protein  86.68 
 
 
384 aa  699  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0015438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0812  hypothetical protein  87.79 
 
 
389 aa  709  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000162038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3441  hypothetical protein  98.44 
 
 
385 aa  780  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00415893  normal  0.25947 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0837  hypothetical protein  87.27 
 
 
389 aa  705  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.240462  hitchhiker  4.96305e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3329  hypothetical protein  98.96 
 
 
385 aa  784  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0693  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  792  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.26756e-05  normal  0.897132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0835  hypothetical protein  90.91 
 
 
385 aa  733  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0603  hypothetical protein  66.67 
 
 
386 aa  506  1e-142  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4131  hypothetical protein  64.03 
 
 
388 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0130576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0546  hypothetical protein  61.52 
 
 
394 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3969  hypothetical protein  64.17 
 
 
390 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3221  hypothetical protein  63.75 
 
 
386 aa  492  1e-138  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0332861  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0578  hypothetical protein  61.56 
 
 
385 aa  484  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.056117  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2971  hypothetical protein  59.72 
 
 
399 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0733  hypothetical protein  42.86 
 
 
391 aa  304  2e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4467  secreted protein  34.98 
 
 
423 aa  149  1e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207667  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2117  secreted protein  29.61 
 
 
415 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1934  hypothetical protein  31.07 
 
 
364 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2682  hypothetical protein  28.77 
 
 
453 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2869  hypothetical protein  28.19 
 
 
537 aa  110  4e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00620  hypothetical protein  26.01 
 
 
553 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486509  normal  0.628936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6996  hypothetical protein  35.18 
 
 
500 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0052  hypothetical protein  26.19 
 
 
553 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17670  hypothetical protein  30.51 
 
 
279 aa  55.1  2e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.276623  normal  0.654681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>