246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0689 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  100 
 
 		 315 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  99.68 
 
 		 315 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  99.05 
 
 		 315 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  97.46 
 
 		 315 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  94.89 
 
 		 317 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  94.89 
 
 		 317 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  94.89 
 
 		 317 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  94.57 
 
 		 317 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  94.89 
 
 		 317 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  88.25 
 
 		 317 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  86.58 
 
 		 317 aa  564  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  85.71 
 
 		 315 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  85.71 
 
 		 319 aa  559  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  86.58 
 
 		 316 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  85.3 
 
 		 316 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  84.03 
 
 		 316 aa  547  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  72.29 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  72.06 
 
 		 315 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  69.84 
 
 		 315 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  69.84 
 
 		 315 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  69.84 
 
 		 315 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  71.57 
 
 		 316 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  71.2 
 
 		 317 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 319 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 315 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  71.43 
 
 		 319 aa  474  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  71.75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  71.75 
 
 		 319 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  69.84 
 
 		 315 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  69.52 
 
 		 315 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  71.25 
 
 		 316 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  70.79 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  70.79 
 
 		 319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  70.79 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  69.33 
 
 		 318 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  68.89 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  68.15 
 
 		 318 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  69.03 
 
 		 320 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  68.37 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  66.13 
 
 		 317 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  65.5 
 
 		 317 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  64.74 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  65.06 
 
 		 317 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  63.78 
 
 		 317 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  63.96 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  63.46 
 
 		 317 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  64.74 
 
 		 319 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  63.46 
 
 		 317 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  64.1 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  60.38 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  62.3 
 
 		 318 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  61.76 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  62.1 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  59.68 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  60.58 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  58.84 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  57.69 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  55.24 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  53.35 
 
 		 321 aa  360  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  53.35 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  54.81 
 
 		 314 aa  358  7e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  56.82 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  53.21 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  52.75 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 325 aa  339  4e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  52.75 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  54.84 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  53.92 
 
 		 313 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  55.48 
 
 		 315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  52.88 
 
 		 316 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  52.1 
 
 		 324 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  51.95 
 
 		 314 aa  335  7.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  51.46 
 
 		 323 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  51.46 
 
 		 323 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  52.26 
 
 		 317 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  50.32 
 
 		 315 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2780  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 317 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  51.29 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  50.81 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  51.27 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  51.27 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 318 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1016  glutathione synthetase  49.67 
 
 		 314 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>