More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0317 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0317  prolyl aminopeptidase  100 
 
 
318 aa  647  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.463031  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  88.64 
 
 
318 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3707  prolyl aminopeptidase  96.01 
 
 
301 aa  576  1e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0312  prolyl aminopeptidase  95.35 
 
 
301 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.361295  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0316  alpha/beta hydrolase fold  66.35 
 
 
317 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  67.2 
 
 
321 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0320  alpha/beta hydrolase fold  66.77 
 
 
317 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0315  alpha/beta hydrolase fold  66.88 
 
 
317 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0142975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3544  alpha/beta hydrolase fold  47.54 
 
 
316 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.369893  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0303  alpha/beta hydrolase fold  46.91 
 
 
317 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.136921  hitchhiker  7.24051e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4617  prolyl aminopeptidase  46.1 
 
 
315 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.920468  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3908  prolyl aminopeptidase  46.2 
 
 
310 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3403  proline iminopeptidase, putative  46.98 
 
 
295 aa  234  2e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  34.17 
 
 
322 aa  173  4e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
313 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  33.9 
 
 
323 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  33.89 
 
 
318 aa  165  1e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  32.91 
 
 
320 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  34.39 
 
 
315 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  36.17 
 
 
316 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1698  prolyl aminopeptidase  37.12 
 
 
320 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  33.23 
 
 
323 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  33.45 
 
 
323 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  34.3 
 
 
323 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  33.8 
 
 
315 aa  156  4e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  33.11 
 
 
323 aa  156  5e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  36.08 
 
 
328 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  32.69 
 
 
323 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  34.69 
 
 
326 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  35.15 
 
 
319 aa  155  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  32.69 
 
 
323 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  32.69 
 
 
323 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  30.69 
 
 
316 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  35.11 
 
 
328 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  34.38 
 
 
319 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
316 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  36.52 
 
 
321 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  30.69 
 
 
316 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  32.36 
 
 
323 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  32.57 
 
 
316 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  33.89 
 
 
330 aa  152  6e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  32.64 
 
 
318 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  35.38 
 
 
335 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  34.34 
 
 
328 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  37.41 
 
 
310 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  37.41 
 
 
310 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  33.22 
 
 
326 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  36.62 
 
 
320 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  30.89 
 
 
325 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  35.94 
 
 
313 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  34.72 
 
 
323 aa  149  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  32.54 
 
 
323 aa  148  1e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  32.77 
 
 
316 aa  148  1e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  34.39 
 
 
313 aa  147  2e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  35.31 
 
 
310 aa  147  2e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  35.31 
 
 
310 aa  147  2e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  31.85 
 
 
323 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  34.34 
 
 
329 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  31.54 
 
 
313 aa  146  4e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  34.72 
 
 
310 aa  145  7e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  34.32 
 
 
329 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  31.33 
 
 
319 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.89953e-08  hitchhiker  3.38054e-05 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  36.49 
 
 
312 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  32.71 
 
 
320 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  36.49 
 
 
312 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  33.22 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
429 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  34.38 
 
 
310 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
429 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
429 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  32.23 
 
 
314 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  33.68 
 
 
329 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  31.61 
 
 
339 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  34.15 
 
 
310 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  36.01 
 
 
436 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
322 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  33.56 
 
 
322 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  36.14 
 
 
312 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  34.38 
 
 
313 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  33.44 
 
 
316 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  32.29 
 
 
329 aa  141  1e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  33.83 
 
 
313 aa  141  2e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  32.62 
 
 
317 aa  139  5e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  34.62 
 
 
321 aa  139  8e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  37.25 
 
 
321 aa  139  8e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  36.1 
 
 
320 aa  139  8e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  29.9 
 
 
322 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  33.1 
 
 
318 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  32.91 
 
 
329 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  35.76 
 
 
414 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  34.02 
 
 
333 aa  137  3e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  32.11 
 
 
342 aa  137  3e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  32.11 
 
 
316 aa  137  3e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  32.87 
 
 
316 aa  137  3e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
324 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  32.99 
 
 
321 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  33 
 
 
329 aa  135  7e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  32.78 
 
 
319 aa  134  2e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  31.6 
 
 
316 aa  134  2e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  31.83 
 
 
317 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>