60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0259 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  99.44 
 
 		 177 aa  361  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  88.14 
 
 		 177 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  96.05 
 
 		 177 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  78.65 
 
 		 179 aa  288  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  80.72 
 
 		 168 aa  277  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  80.12 
 
 		 168 aa  276  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  79.52 
 
 		 168 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  78.92 
 
 		 168 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  49.43 
 
 		 178 aa  187  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  50.56 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  47.2 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  54.36 
 
 		 174 aa  160  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  46.07 
 
 		 183 aa  157  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  46.75 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  48.72 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  33.52 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  33.52 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  30.9 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  32.24 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  33.14 
 
 		 203 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  33.56 
 
 		 208 aa  84.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  32.03 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  27.37 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  29.61 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  27.27 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  28.29 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  31.65 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  31.18 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  27.52 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  27.84 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  32.12 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  28.95 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  28.28 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  28.67 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  29.03 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  34.53 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  31.5 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  30.71 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  32.85 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  28.38 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  27.22 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  27.45 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  25.77 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  38.75 
 
 		 298 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  47.17 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  29.63 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  45.65 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  57.14 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  52.5 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  47.22 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  32.81 
 
 		 178 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  40.43 
 
 		 151 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  46.34 
 
 		 284 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  35.21 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  41.03 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  37.74 
 
 		 300 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>