More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0173 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  92.26 
 
 
620 aa  1155    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0194  acyltransferase family protein  94.67 
 
 
620 aa  1142    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  69.69 
 
 
617 aa  889    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0133  phospholipid/glycerol acyltransferase  81.45 
 
 
620 aa  1011    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  91.45 
 
 
620 aa  1121    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  67.59 
 
 
618 aa  885    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  91.77 
 
 
620 aa  1117    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
620 aa  1260    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  97.58 
 
 
620 aa  1186    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0122  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.05 
 
 
618 aa  931    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.430079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  91.29 
 
 
620 aa  1118    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  96.27 
 
 
621 aa  1164    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  74.6 
 
 
618 aa  953    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  91.77 
 
 
620 aa  1124    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4343  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.82 
 
 
589 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.86 
 
 
625 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.92 
 
 
626 aa  598  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  50 
 
 
626 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2856  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.35 
 
 
637 aa  588  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000113007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  50.16 
 
 
624 aa  591  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  49.51 
 
 
624 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3147  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.03 
 
 
624 aa  545  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733327  normal  0.020121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21750  hypothetical protein  49.04 
 
 
624 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.783419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.95 
 
 
625 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.449657  decreased coverage  0.00341201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1854  hypothetical protein  47.67 
 
 
624 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.38 
 
 
625 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1700  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.22 
 
 
661 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1665  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.32 
 
 
624 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054165  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.99 
 
 
625 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1586  phospholipid/glycerol acyltransferase:phospholipid/glycerol acyltransferase  47.58 
 
 
624 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  44.17 
 
 
644 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3899  acyltransferase family protein  47.1 
 
 
624 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.516687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.5 
 
 
644 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.5 
 
 
644 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.5 
 
 
644 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.5 
 
 
644 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.5 
 
 
644 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.77 
 
 
635 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.28 
 
 
635 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.23 
 
 
644 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.04 
 
 
632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  44.01 
 
 
644 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.82 
 
 
634 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  44.01 
 
 
644 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  44.73 
 
 
635 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0159  major facilitator transporter  58.61 
 
 
560 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  43.85 
 
 
644 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  44.01 
 
 
644 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.62 
 
 
645 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.04 
 
 
645 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  43.62 
 
 
645 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3020  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.03 
 
 
629 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.36 
 
 
654 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3732  putative transmembrane protein  44.77 
 
 
632 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.896523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4497  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.49 
 
 
644 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.170703 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  45.23 
 
 
604 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  45.23 
 
 
604 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3878  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.72 
 
 
651 aa  475  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828126  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3151  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.72 
 
 
651 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.32 
 
 
629 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5079  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.69 
 
 
652 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0457  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.57 
 
 
653 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409377  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02956  2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  40.92 
 
 
640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.9 
 
 
658 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.54 
 
 
644 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3058  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.61 
 
 
662 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.024597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4715  major facilitator transporter  56.03 
 
 
429 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  42.58 
 
 
446 aa  345  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  42.34 
 
 
446 aa  341  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 
432 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1608  major facilitator transporter  41.39 
 
 
439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000040432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01330  major facilitator superfamily (MFS_1) protein  46.17 
 
 
453 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.11 
 
 
1155 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.39 
 
 
1131 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.98 
 
 
1114 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5738  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.17 
 
 
1144 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1780  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.05 
 
 
1138 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1501  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.33 
 
 
1138 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.87 
 
 
1124 aa  281  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2776  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.29 
 
 
1129 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.72 
 
 
1137 aa  276  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  38.22 
 
 
429 aa  273  8.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  39.24 
 
 
431 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  38.08 
 
 
438 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1502  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.72 
 
 
1138 aa  270  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.780904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.93 
 
 
1136 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.4 
 
 
1128 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.66 
 
 
1146 aa  264  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1222  hypothetical protein  37.98 
 
 
435 aa  261  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1222  hypothetical protein  37.98 
 
 
435 aa  261  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0679  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.4 
 
 
1131 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120041  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0737  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.12 
 
 
1131 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00473153  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
1185 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1334  major facilitator transporter  39.24 
 
 
440 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0164505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.28 
 
 
1139 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4578  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  29.36 
 
 
1139 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.557589  normal  0.0311221 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.7 
 
 
1170 aa  207  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0197  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
430 aa  207  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31792 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1253  major facilitator transporter  33.17 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.717143  decreased coverage  0.0000211446 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0955  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.95 
 
 
1170 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000517979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>