50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0145 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  93.3 
 
 		 627 aa  1216    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  71.48 
 
 		 612 aa  929    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  74.83 
 
 		 615 aa  929    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  84.19 
 
 		 683 aa  1175    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  83.89 
 
 		 683 aa  1171    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  84.53 
 
 		 663 aa  1153    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  73.55 
 
 		 627 aa  925    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  74.39 
 
 		 613 aa  910    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  83.92 
 
 		 684 aa  1176    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  84.19 
 
 		 683 aa  1175    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  70.73 
 
 		 610 aa  887    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  96.06 
 
 		 659 aa  1292    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.33 
 
 		 619 aa  889    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  93.38 
 
 		 665 aa  1268    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 658 aa  1355    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.3 
 
 		 631 aa  592  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.77 
 
 		 609 aa  535  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.87 
 
 		 634 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  40.1 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  35.36 
 
 		 592 aa  328  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.95 
 
 		 581 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.2 
 
 		 581 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.23 
 
 		 581 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.81 
 
 		 580 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  30.36 
 
 		 570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  29.4 
 
 		 576 aa  260  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.18 
 
 		 577 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.97 
 
 		 580 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  28.19 
 
 		 575 aa  239  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.33 
 
 		 526 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  24.6 
 
 		 484 aa  146  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.46 
 
 		 599 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.7 
 
 		 618 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.71 
 
 		 606 aa  90.1  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.71 
 
 		 606 aa  90.1  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  21.39 
 
 		 541 aa  87.4  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.18 
 
 		 615 aa  87  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.19 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.64 
 
 		 557 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.29 
 
 		 361 aa  51.2  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.6 
 
 		 840 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.06 
 
 		 585 aa  50.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.05 
 
 		 862 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  25.81 
 
 		 823 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.07 
 
 		 553 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.5 
 
 		 837 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  19.96 
 
 		 906 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.56 
 
 		 568 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  22.32 
 
 		 923 aa  45.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.03 
 
 		 375 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>