176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0133 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  97.75 
 
 
178 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  97.75 
 
 
178 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  97.75 
 
 
178 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  97.75 
 
 
178 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  97.19 
 
 
178 aa  358  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  96.07 
 
 
178 aa  353  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  84 
 
 
175 aa  311  2e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  84.21 
 
 
174 aa  308  3e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  84.21 
 
 
175 aa  306  1e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  81.61 
 
 
175 aa  305  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  81.5 
 
 
175 aa  303  8e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  76.61 
 
 
175 aa  278  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  75.44 
 
 
175 aa  276  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  73.56 
 
 
175 aa  271  4e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  73.14 
 
 
181 aa  271  5e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  71.84 
 
 
175 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  68.48 
 
 
172 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  65.48 
 
 
169 aa  240  8e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  65.48 
 
 
169 aa  240  8e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  65.48 
 
 
169 aa  240  8e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  66.67 
 
 
169 aa  238  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  67.48 
 
 
168 aa  237  7e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  67.48 
 
 
168 aa  236  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  68.1 
 
 
166 aa  235  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  64.6 
 
 
161 aa  231  4e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  64.63 
 
 
165 aa  227  6e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  62.42 
 
 
165 aa  224  5e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  1.16181e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  62.42 
 
 
165 aa  224  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  62.42 
 
 
165 aa  224  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  62.42 
 
 
165 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  62.42 
 
 
165 aa  224  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.46321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  62.42 
 
 
165 aa  224  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.4289e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  62.42 
 
 
165 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  62.42 
 
 
165 aa  224  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90475e-09 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  61.82 
 
 
165 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  61.82 
 
 
165 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  61.82 
 
 
165 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  4.82664e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  61.82 
 
 
165 aa  221  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  61.82 
 
 
165 aa  220  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  4.65713e-11 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  61.82 
 
 
165 aa  220  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  61.82 
 
 
165 aa  216  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  57.47 
 
 
175 aa  213  1e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  51.83 
 
 
164 aa  181  4e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  50.62 
 
 
167 aa  177  5e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  50.62 
 
 
167 aa  177  5e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  50.62 
 
 
167 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  46.91 
 
 
162 aa  172  2e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  45.96 
 
 
166 aa  154  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  43.93 
 
 
172 aa  154  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  45 
 
 
170 aa  149  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  46.88 
 
 
171 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  40.61 
 
 
176 aa  140  1e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  46.25 
 
 
169 aa  138  4e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  45.28 
 
 
168 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  3.23257e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  41.51 
 
 
171 aa  134  6e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  43.75 
 
 
164 aa  132  2e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  38.75 
 
 
168 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.92038e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  43.4 
 
 
165 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  45 
 
 
162 aa  131  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  38.75 
 
 
173 aa  129  2e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.53889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  129  2e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  38.79 
 
 
171 aa  129  2e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  40.88 
 
 
172 aa  129  2e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48628e-10 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  42.14 
 
 
176 aa  129  2e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  40.88 
 
 
172 aa  129  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  41.51 
 
 
173 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  40.25 
 
 
170 aa  128  4e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.19081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  40.25 
 
 
170 aa  127  7e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.20561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  38.99 
 
 
172 aa  127  9e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  40.48 
 
 
166 aa  127  1e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  39.38 
 
 
164 aa  125  4e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  40.25 
 
 
167 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  39.05 
 
 
176 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.24545e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  41.25 
 
 
165 aa  124  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  39.62 
 
 
167 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  38.12 
 
 
174 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.56866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  37.01 
 
 
174 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.15587e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  37.29 
 
 
177 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  39.02 
 
 
164 aa  120  1e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  40 
 
 
171 aa  120  1e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.23127e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 
169 aa  119  2e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  39.87 
 
 
163 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  38.99 
 
 
162 aa  118  4e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.20076e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  36.25 
 
 
173 aa  118  5e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.65061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  37.5 
 
 
175 aa  117  8e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  36.88 
 
 
175 aa  117  8e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  35.44 
 
 
171 aa  117  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  37.85 
 
 
172 aa  117  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  38.12 
 
 
162 aa  116  1e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  38.04 
 
 
163 aa  115  2e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.82999e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  37.11 
 
 
171 aa  116  2e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  36.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.5071e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 
175 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  38.12 
 
 
161 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  36.25 
 
 
168 aa  115  4e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  39.61 
 
 
164 aa  114  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  4.4787e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  36.25 
 
 
168 aa  114  7e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.0835e-10  hitchhiker  1.91654e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>