285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0100 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
513 aa  1038  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  67.4 
 
 
506 aa  686  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  67.4 
 
 
506 aa  686  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  70.81 
 
 
510 aa  747  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  95.71 
 
 
513 aa  1002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  91.18 
 
 
510 aa  946  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  89.02 
 
 
510 aa  932  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  67.65 
 
 
510 aa  691  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  67.4 
 
 
506 aa  685  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  96.1 
 
 
513 aa  1008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  73.43 
 
 
511 aa  761  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  65.74 
 
 
509 aa  671  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  67.4 
 
 
506 aa  686  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  89.11 
 
 
510 aa  918  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
513 aa  1038  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  95.71 
 
 
513 aa  1003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  72.58 
 
 
510 aa  754  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  88.32 
 
 
512 aa  909  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  66.27 
 
 
509 aa  655  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  67.4 
 
 
506 aa  686  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5047  histidine ammonia-lyase  67.06 
 
 
518 aa  672  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114235  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  67.2 
 
 
506 aa  682  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
513 aa  1038  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  67.67 
 
 
538 aa  665  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5637  histidine ammonia-lyase  67.26 
 
 
518 aa  669  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  89.02 
 
 
510 aa  931  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  66.34 
 
 
515 aa  677  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  68.24 
 
 
510 aa  699  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  71.99 
 
 
511 aa  746  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4137  histidine ammonia-lyase  66.28 
 
 
510 aa  655  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0926785  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  66.07 
 
 
524 aa  649  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  98.25 
 
 
513 aa  1021  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  73.15 
 
 
514 aa  776  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  95.91 
 
 
513 aa  1002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  95.91 
 
 
513 aa  1004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4085  histidine ammonia-lyase  66.28 
 
 
510 aa  655  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  91.76 
 
 
510 aa  952  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  72.51 
 
 
514 aa  761  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  68.24 
 
 
510 aa  700  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  69.37 
 
 
511 aa  715  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  66.73 
 
 
515 aa  687  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  68.24 
 
 
510 aa  703  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0077  histidine ammonia-lyase  66.28 
 
 
510 aa  655  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  68.43 
 
 
510 aa  702  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  67.25 
 
 
511 aa  671  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  74.56 
 
 
511 aa  768  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.07913e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  61.8 
 
 
507 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  63.3 
 
 
511 aa  605  1e-172  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  63.4 
 
 
507 aa  603  1e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  62.85 
 
 
507 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  62.2 
 
 
507 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  64.6 
 
 
529 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  62.4 
 
 
507 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  64.6 
 
 
529 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  64.6 
 
 
507 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  64.6 
 
 
533 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  64.6 
 
 
507 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  64.6 
 
 
507 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  64.6 
 
 
507 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  62.2 
 
 
506 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  62.2 
 
 
507 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  62 
 
 
507 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  63.98 
 
 
514 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  59.76 
 
 
506 aa  583  1e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  60.96 
 
 
514 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  59.76 
 
 
506 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  62.2 
 
 
507 aa  577  1e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  62.2 
 
 
507 aa  577  1e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  57.93 
 
 
519 aa  578  1e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  61.3 
 
 
518 aa  577  1e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  60.36 
 
 
518 aa  574  1e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26290  histidine ammonia-lyase  60.52 
 
 
509 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  58.82 
 
 
515 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  60.69 
 
 
518 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  60 
 
 
518 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  57.7 
 
 
514 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  57.59 
 
 
517 aa  545  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1264  histidine ammonia-lyase  60.2 
 
 
518 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1482  histidine ammonia-lyase  57.89 
 
 
510 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468777  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  56.47 
 
 
513 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  57.35 
 
 
507 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  55.14 
 
 
520 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  58.05 
 
 
526 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  55.69 
 
 
523 aa  517  1e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  57.65 
 
 
522 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  58.06 
 
 
513 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  57.6 
 
 
506 aa  509  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  55.11 
 
 
509 aa  506  1e-142  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  53.24 
 
 
511 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  53.05 
 
 
511 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  54.22 
 
 
511 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  53.63 
 
 
511 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  53.05 
 
 
511 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  61.04 
 
 
515 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  54.17 
 
 
511 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1689  histidine ammonia-lyase  55.16 
 
 
509 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  52.85 
 
 
511 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  52.85 
 
 
511 aa  494  1e-138  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3645  histidine ammonia-lyase  55.27 
 
 
520 aa  493  1e-138  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2965  histidine ammonia-lyase  54.97 
 
 
512 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.048059  normal  0.285122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>