202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0096 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  100 
 
 
248 aa  514  1e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  98.39 
 
 
248 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  97.98 
 
 
250 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  83 
 
 
252 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  83 
 
 
247 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  83.4 
 
 
250 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  83 
 
 
250 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  83 
 
 
251 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  61.07 
 
 
247 aa  324  7e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  56.97 
 
 
246 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  47.1 
 
 
272 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0997  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  52.38 
 
 
210 aa  225  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18529e-07 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  44.57 
 
 
257 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  42.97 
 
 
257 aa  197  1e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  36.69 
 
 
277 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.51 
 
 
281 aa  155  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.8 
 
 
279 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  34.9 
 
 
271 aa  145  4e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  37.24 
 
 
247 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  34.85 
 
 
297 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  35.51 
 
 
281 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  35.57 
 
 
270 aa  134  1e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  35.66 
 
 
258 aa  134  1e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  34.41 
 
 
288 aa  133  2e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.89 
 
 
272 aa  132  4e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  36.32 
 
 
274 aa  132  7e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.94 
 
 
370 aa  131  1e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  34.45 
 
 
289 aa  131  1e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  36.03 
 
 
273 aa  130  2e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  35.63 
 
 
279 aa  130  2e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  33.95 
 
 
277 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2259  FAD-binding 9, siderophore-interacting  28.69 
 
 
254 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  34.47 
 
 
304 aa  128  9e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  33.87 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  33.87 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  33.87 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  33.87 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  33.87 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  33.87 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  33.87 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  32.92 
 
 
278 aa  126  4e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.93 
 
 
289 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  34.77 
 
 
279 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  33.21 
 
 
277 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  32.54 
 
 
617 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2392  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.71 
 
 
264 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.82 
 
 
273 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.82 
 
 
273 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.63 
 
 
273 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  32.44 
 
 
273 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.82 
 
 
273 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  32.93 
 
 
284 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.77 
 
 
283 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  35.55 
 
 
266 aa  122  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  34.41 
 
 
273 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  34.41 
 
 
265 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.06 
 
 
283 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  32.79 
 
 
255 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  34.78 
 
 
366 aa  121  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  37.72 
 
 
251 aa  121  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  34.02 
 
 
274 aa  120  1e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  33.46 
 
 
290 aa  121  1e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.73 
 
 
280 aa  121  1e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  30.83 
 
 
281 aa  120  2e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  35.29 
 
 
253 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  32.38 
 
 
255 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  31.33 
 
 
311 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  32.66 
 
 
275 aa  119  5e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.18 
 
 
296 aa  119  5e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  32.21 
 
 
285 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.52 
 
 
270 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.32 
 
 
277 aa  117  1e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  31.75 
 
 
281 aa  117  1e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.87 
 
 
253 aa  117  1e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.06 
 
 
281 aa  117  1e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  31.32 
 
 
285 aa  117  2e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  33.86 
 
 
277 aa  117  2e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.87 
 
 
253 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.54 
 
 
285 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  34.96 
 
 
354 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  32.26 
 
 
275 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  31.76 
 
 
280 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  32.83 
 
 
295 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.54 
 
 
285 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  30.34 
 
 
340 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  5.30029e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  33.6 
 
 
261 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.89 
 
 
274 aa  114  2e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.29 
 
 
252 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2266  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.28 
 
 
267 aa  113  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.56 
 
 
278 aa  112  4e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  33.07 
 
 
276 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  32.07 
 
 
272 aa  111  1e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  31.05 
 
 
273 aa  111  1e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  33.86 
 
 
277 aa  110  2e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.46 
 
 
271 aa  110  2e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  33.21 
 
 
283 aa  109  4e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.3443e-14  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2573  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.09 
 
 
267 aa  109  4e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.09 
 
 
267 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  31.43 
 
 
623 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.49 
 
 
348 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>