191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0094 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1303  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  74.32 
 
 
621 aa  967  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  98.74 
 
 
635 aa  1292  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  98.74 
 
 
635 aa  1290  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  38.41 
 
 
633 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  37.48 
 
 
630 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  39.45 
 
 
628 aa  419  1e-115  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.65722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  37.74 
 
 
636 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  39.06 
 
 
639 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  37.26 
 
 
609 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.81 
 
 
608 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  36.38 
 
 
607 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  36.38 
 
 
607 aa  347  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  36.64 
 
 
610 aa  347  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  36.38 
 
 
607 aa  346  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  5.15921e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  38.41 
 
 
611 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  35.95 
 
 
605 aa  342  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  33.93 
 
 
615 aa  340  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  32.7 
 
 
602 aa  338  1e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  39 
 
 
614 aa  337  6e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  33.71 
 
 
615 aa  336  9e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  33.39 
 
 
615 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  33.33 
 
 
614 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  38.51 
 
 
614 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  38.8 
 
 
614 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  35.07 
 
 
616 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  38 
 
 
614 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  35.07 
 
 
616 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.02664e-05  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  35.57 
 
 
622 aa  333  7e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  34 
 
 
616 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.23999e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  35.08 
 
 
615 aa  332  9e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  34 
 
 
616 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.81618e-06  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  32.63 
 
 
617 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  32.96 
 
 
628 aa  330  5e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  38.56 
 
 
617 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  34.72 
 
 
614 aa  327  5e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  32.72 
 
 
618 aa  324  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.73 
 
 
611 aa  316  9e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.55519e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.5 
 
 
613 aa  314  3e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.82029e-06  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  35.98 
 
 
604 aa  313  7e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  32.22 
 
 
617 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.89 
 
 
627 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  30.73 
 
 
613 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  34.44 
 
 
609 aa  304  3e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.17 
 
 
603 aa  304  3e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  33.5 
 
 
625 aa  304  3e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  32.81 
 
 
601 aa  303  6e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  31.85 
 
 
603 aa  303  6e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26014e-10 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  36.84 
 
 
586 aa  303  8e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  32.1 
 
 
601 aa  303  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  32.87 
 
 
601 aa  303  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  32.66 
 
 
601 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.01 
 
 
603 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  33.97 
 
 
609 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  33.6 
 
 
609 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  6.339e-11 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.54 
 
 
591 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  33.97 
 
 
609 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  33.97 
 
 
609 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  3.491e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  33.65 
 
 
611 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.85801e-09 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  33.59 
 
 
616 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  34.02 
 
 
609 aa  300  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.26 
 
 
1283 aa  300  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  33.44 
 
 
609 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  34.99 
 
 
629 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  31.44 
 
 
625 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  31.8 
 
 
603 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  36.25 
 
 
628 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.17 
 
 
619 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  32.8 
 
 
599 aa  297  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  33.65 
 
 
609 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  32.97 
 
 
607 aa  293  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  31.43 
 
 
603 aa  293  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  31.69 
 
 
605 aa  293  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.74 
 
 
588 aa  293  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  33.46 
 
 
618 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.60677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  33.85 
 
 
611 aa  292  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  33.23 
 
 
609 aa  290  5e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  32.48 
 
 
585 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  32.09 
 
 
610 aa  290  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  31.28 
 
 
624 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.99463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  33.84 
 
 
594 aa  286  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  32.92 
 
 
616 aa  286  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.86308e-06  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.65 
 
 
602 aa  283  5e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  32.43 
 
 
599 aa  283  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.6 
 
 
619 aa  280  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  33.57 
 
 
590 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  31.88 
 
 
587 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  32.03 
 
 
609 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  33.7 
 
 
592 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  40.16 
 
 
599 aa  271  3e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  30.77 
 
 
610 aa  271  3e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  35.71 
 
 
621 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.55 
 
 
583 aa  267  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  32.08 
 
 
605 aa  256  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.69 
 
 
595 aa  254  4e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.89 
 
 
608 aa  254  5e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  31 
 
 
589 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  31.44 
 
 
598 aa  253  8e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  31.5 
 
 
621 aa  253  9e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.89 
 
 
608 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>